RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 TDP2O95551 362 aa30.68■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 CCNE2O96020 404 aa30.68■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa30.68■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 SHHQ15465 462 aa30.68■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 MYH7BA7E2Y1 1941 aa30.68■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 ACTR2P61160 394 aa30.67■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 INF2Q27J81 1249 aa30.67■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 WNT8BQ93098 351 aa30.67■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 FAM205CA6NFA0 338 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 XBP1P17861 261 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 SETQ01105 290 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 NR5A1Q13285 461 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 C16orf59Q7L2K0 433 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 KRT25Q7Z3Z0 450 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 SCLYQ96I15 445 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF577Q9BSK1 485 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 NOD1Q9Y239 953 aa30.66■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa30.65■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
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TPGS1-201ENST00000359315 USP11P51784 963 aa30.65■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP30.65■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 GJA10Q969M2 543 aa30.65■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 RNPEPQ9H4A4 650 aa30.65■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 ACRP10323 421 aa30.64■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 HOXC8P31273 242 aa30.64■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 TNFRSF25Q93038 417 aa30.64■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 VWCEQ96DN2 955 aa30.64■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
TPGS1-201ENST00000359315 MSH4O15457 936 aa30.63■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 ST18O60284 1047 aa30.63■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 LGR5O75473 907 aa30.63■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 KRT40Q6A162 431 aa30.63■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa30.63■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM199Q8N511 208 aa30.63■■■□□ 2.49
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TPGS1-201ENST00000359315 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa30.62■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 GUCY1B3Q02153 619 aa30.62■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 GLG1Q92896 1179 aa30.62■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 SETD4Q9NVD3 440 aa30.62■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 C17orf102A2RUQ5 167 aa30.61■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 ATG7O95352 703 aa30.61■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 MMP1P03956 469 aa30.61■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 KRT2P35908 639 aa30.61■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP30.61■■■□□ 2.49
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TPGS1-201ENST00000359315 MBOAT7Q96N66 472 aa30.61■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 TREHO43280 583 aa30.6■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 SLC37A4O43826 429 aa30.6■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 LETM2Q2VYF4 491 aa30.6■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 LRCH3Q96II8 777 aa30.6■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa30.59■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 BTBD18B2RXH4 712 aa30.59■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 CYP3A7P24462 503 aa30.59■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 Q4G0T1 1027 aa30.59■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 ABHD15Q6UXT9 468 aa30.59■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
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TPGS1-201ENST00000359315 TMX3Q96JJ7 454 aa30.59■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa30.59■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 ERAP1Q9NZ08 941 aa30.59■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa30.58■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 PITPNM1O00562 1244 aa30.58■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 PTK7Q13308 1070 aa30.58■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM240Q5SV17 173 aa30.58■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 NEK8Q86SG6 692 aa30.58■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 SLC5A5Q92911 643 aa30.58■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 ATP6V0A1Q93050 837 aa30.58■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 IL23AQ9NPF7 189 aa30.58■■■□□ 2.49
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D22BQ9NU19 505 aa30.58■■■□□ 2.49
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TPGS1-201ENST00000359315 LRIT3Q3SXY7 679 aa30.57■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 MOXD1Q6UVY6 613 aa30.57■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF365Q70YC5 407 aa30.57■■■□□ 2.48
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TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB10Q96DT7 871 aa30.57■■■□□ 2.48
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TPGS1-201ENST00000359315 RBL2Q08999 1139 aa30.56■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 PPFIA1Q13136 1202 aa30.56■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM29Q14134 588 aa30.56■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 GPNMBQ14956 572 aa30.56■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 TRAF7Q6Q0C0 670 aa30.56■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 ETNPPLQ8TBG4 499 aa30.56■■■□□ 2.48
TPGS1-201ENST00000359315 CAGE1Q8TC20 777 aa30.56■■■□□ 2.48
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