RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CALM1P0DP23 149 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CALM2P0DP24 149 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CALM3P0DP25 149 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 RFC4P35249 363 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 NLRP5P59047 1200 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 TRPC6Q9Y210 931 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 BTAF1O14981 1849 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 KLHL33A6NCF5 533 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 DDAH1O94760 285 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 ANP32DO95626 131 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CCNE1P24864 410 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CCDC63Q8NA47 563 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 ISCUQ9H1K1 167 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 GRID2IPA4D2P6 1211 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CCT8L1PA6NM43 557 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 ORC4O43929 436 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 PDE6BP35913 854 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 LONP1P36776 959 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 TNNC1P63316 161 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 TFAP4Q01664 338 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 LRRC45Q96CN5 670 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 SIK3Q9Y2K2 1263 aa18.42■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 SPAG5Q96R06 1193 aa18.41■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 BICDL2A1A5D9 508 aa18.41■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 MYBP10242 640 aa18.41■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.41■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 ICA1Q05084 483 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 EHHADHQ08426 723 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 AP1ARQ63HQ0 302 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CCDC197Q8NCU1 140 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 MDM1Q8TC05 714 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CHMP6Q96FZ7 201 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 SH3GL3Q99963 347 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 NEUROG2Q9H2A3 272 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 USP21Q9UK80 565 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 FBXL5Q9UKA1 691 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 ENO4A6NNW6 628 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 PCP11498 1178 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 SCG2P13521 617 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 AGBL2Q5U5Z8 902 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 FAM196AQ6ZSG2 479 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 STAG2Q8N3U4 1231 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 PARD3BQ8TEW8 1205 aa18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 USP17L3A6NCW0 530 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 USP17L4A6NCW7 530 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 TRAPPC10P48553 1259 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 USP38Q8NB14 1042 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 IQCDQ96DY2 449 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 SAAL1Q96ER3 474 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 ZNF570Q96NI8 536 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 SLC12A4Q9UP95 1085 aa18.39■□□□□ 0.54
GDE1-201ENST00000353258 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 STK4Q13043 487 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 AGAP11Q8TF27 550 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 FLT3P36888 993 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 ADCY2Q08462 1091 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 KRT71Q3SY84 523 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 CHADLQ6NUI6 762 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 LRRC15Q8TF66 581 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 NDST4Q9H3R1 872 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 IL17RBQ9NRM6 502 aa18.39■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 PDE4DQ08499 809 aa18.38■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 RIPK1Q13546 671 aa18.38■□□□□ 0.53
GDE1-201ENST00000353258 CUL1Q13616 776 aa18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms