RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 PNMA5Q96PV4 448 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CUEDC2Q9H467 287 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 JADE2Q9NQC1 790 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ANO10Q9NW15 660 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 PLXNB2O15031 1838 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 A0A087WWV3 80 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 PSMD10O75832 226 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ERVK-9P63128 1117 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ERVK-24P63145 666 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SMARCE1Q969G3 411 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 BIN1O00499 593 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 NR3C2P08235 984 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 DPYDQ12882 1025 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 IRF5Q13568 498 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ECM1Q16610 540 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 HYIQ5T013 277 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 RGMBQ6NW40 437 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ARL10Q8N8L6 244 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 RNF214Q8ND24 703 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MNS1Q8NEH6 495 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 DNERQ8NFT8 737 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 PTPN18Q99952 460 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.76□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SMC2O95347 1197 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 PPP2R5CQ13362 524 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MTMR1Q13613 665 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ERMNQ8TAM6 284 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SPATA20Q8TB22 786 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 STAMQ92783 540 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 IWS1Q96ST2 819 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MTRQ99707 1265 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MROH8Q9H579 483 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 WDR70Q9NW82 654 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 STK17AQ9UEE5 414 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 GAS7O60861 476 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CAPN2P17655 700 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CASP1P29466 404 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 TERF1P54274 439 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CNTN2Q02246 1040 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CUL4BQ13620 913 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ISM2Q6H9L7 571 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 RAD54LQ92698 747 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MMP19Q99542 508 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 RIT2Q99578 217 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CCP110O43303 1012 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CAND2O75155 1236 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MED24O75448 989 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 STAM2O75886 525 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CAVIN2O95810 425 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 SLC10A3P09131 477 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ITFG2Q969R8 447 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CBX8Q9HC52 389 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ASTN1O14525 1302 aa6.75□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 POTEB2H3BUK9 544 aa6.74□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 EML1O00423 815 aa6.74□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 CCNA1P78396 465 aa6.74□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 MORC3Q14149 939 aa6.74□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.74□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 NLRX1Q86UT6 975 aa6.74□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.74□□□□□ -1.33
CCR6-201ENST00000341935 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms