RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 MUTP22033 750 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 AMPD3Q01432 767 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SEMA3FQ13275 785 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 PPP2R5CQ13362 524 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 LONRF3Q496Y0 759 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 PDILTQ8N807 584 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 DPF3Q92784 378 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 DHX58Q96C10 678 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 ASB14A6NK59 587 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SMC2O95347 1197 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 PDE4DQ08499 809 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 USP49Q70CQ1 688 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 IL31RAQ8NI17 732 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 NEK9Q8TD19 979 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.22■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 PSMD10O75832 226 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 ADORA2AP29274 412 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 CNTN2Q02246 1040 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 HYIQ5T013 277 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 TSPY26PQ9H489 355 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 MCM3APO60318 1980 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 H0YGN5 161 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 PGK2P07205 417 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 ARP10275 920 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 EDNRBP24530 442 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 POSTNQ15063 836 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 RDM1Q8NG50 284 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 PANK2Q9BZ23 570 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYNE4-201ENST00000324444 POTEMA6NI47 508 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 HOXC6P09630 235 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 TGFB3P10600 412 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 RPA1P27694 616 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 ICAM3P32942 547 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 KRT76Q01546 638 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 E2F4Q16254 413 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 VAV3Q9UKW4 847 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 NFASCO94856 1347 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 COBLO75128 1261 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 SFNP31947 248 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 EPHA7Q15375 998 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 DPP9Q86TI2 863 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 ANO10Q9NW15 660 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 PP2D1A8MPX8 630 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 PLCG1P19174 1290 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 CDC25AP30304 524 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 JAK3P52333 1124 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 SV2BQ7L1I2 683 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 MORC4Q8TE76 937 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 SMARCE1Q969G3 411 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 PAGE5Q96GU1 130 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 RMND1Q9NWS8 449 aa20.18■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 A0A087X0B3 334 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 SLC34A2O95436 690 aa20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYNE4-201ENST00000324444 STX1AQ16623 288 aa20.17■□□□□ 0.82
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