RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 OXER1Q8TDS5 423 aa28.36■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.36■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 TRIM29Q14134 588 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 TMEM199Q8N511 208 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 LENG9Q96B70 501 aa28.35■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 DHX15O43143 795 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 CCL23P55773 120 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 ACTR2P61160 394 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 INF2Q27J81 1249 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 BRMS1Q9HCU9 246 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D22BQ9NU19 505 aa28.34■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 CYP3A7P24462 503 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 KRT2P35908 639 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 EPHB4P54760 987 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 GLG1Q92896 1179 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.33■■■□□ 2.13
CXCL2-201ENST00000296031 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 MMP1P03956 469 aa28.32■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 CSF2RAP15509 400 aa28.32■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 KRT40Q6A162 431 aa28.32■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.32■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.32■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 TDP2O95551 362 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 CCNE2O96020 404 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 MARK3P27448 753 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 MCM2P49736 904 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 NR5A1Q13285 461 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 HIC1Q14526 733 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 Q4G0T1 1027 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 MOXD1Q6UVY6 613 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 AZI2Q9H6S1 392 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 EMSYQ7Z589 1322 aa28.31■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 KAT6AQ92794 2004 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 MSH4O15457 936 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 LGR5O75473 907 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 ATG7O95352 703 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 BFSP2Q13515 415 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 SHHQ15465 462 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 SCLYQ96I15 445 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 TMX3Q96JJ7 454 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 PCYT2Q99447 389 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa28.3■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 PITPNM1O00562 1244 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 HOXC8P31273 242 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 LETM2Q2VYF4 491 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 NEK8Q86SG6 692 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 FAM184AQ8NB25 1140 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 RETREG2Q8NC44 543 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 TNFRSF25Q93038 417 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 MBOAT7Q96N66 472 aa28.29■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 BTBD18B2RXH4 712 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 ACRP10323 421 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 GUCY1B3Q02153 619 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 PTK7Q13308 1070 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 ABHD15Q6UXT9 468 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 SLC5A5Q92911 643 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 C8orf76Q96K31 380 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 RIT2Q99578 217 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 SETD4Q9NVD3 440 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 SCN5AQ14524 2016 aa28.28■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 FAM205CA6NFA0 338 aa28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 GNAT1P11488 350 aa28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 STAT5BP51692 787 aa28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 KRT76Q01546 638 aa28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 CAGE1Q8TC20 777 aa28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 IL23AQ9NPF7 189 aa28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CXCL2-201ENST00000296031 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.26■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 BACH1O14867 736 aa28.26■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 PPP4R3AQ6IN85 833 aa28.26■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa28.26■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.26■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 SERINC5Q86VE9 423 aa28.26■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 GJA10Q969M2 543 aa28.26■■■□□ 2.11
CXCL2-201ENST00000296031 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
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