RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 CYP3A7P24462 503 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 EPHB4P54760 987 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 HIC1Q14526 733 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 RABEP1Q15276 862 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 PTGISQ16647 500 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 TMEM199Q8N511 208 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 TBCKQ8TEA7 893 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 BACH2Q9BYV9 841 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 TET1Q8NFU7 2136 aa9.58□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 MYO9BQ13459 2157 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 JAK2O60674 1132 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 CSF2RAP15509 400 aa9.57□□□□□ -0.88
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PPARG-201ENST00000287820 SP4Q02446 784 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 FPGSQ05932 587 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 LENG9Q96B70 501 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 PCYT2Q99447 389 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 SDF4Q9BRK5 362 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 PITPNM1O00562 1244 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 LGR5O75473 907 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 CCL23P55773 120 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 ACTR2P61160 394 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 ADAM17P78536 824 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 PRR16Q569H4 304 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 OXER1Q8TDS5 423 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 VWCEQ96DN2 955 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.57□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 CCNE2O96020 404 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 IQCF3P0C7M6 154 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 PTK7Q13308 1070 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 BFSP2Q13515 415 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 Q4G0T1 1027 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 TMEM240Q5SV17 173 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 TRIM50Q86XT4 487 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 MBOAT7Q96N66 472 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 35.2
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PPARG-201ENST00000287820 IL23AQ9NPF7 189 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 NOD1Q9Y239 953 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 WDR81Q562E7 1941 aa9.56□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 MSH4O15457 936 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 ST18O60284 1047 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 STAT5BP51692 787 aa9.55□□□□□ -0.88
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PPARG-201ENST00000287820 INF2Q27J81 1249 aa9.55□□□□□ -0.88
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PPARG-201ENST00000287820 KRT40Q6A162 431 aa9.55□□□□□ -0.88
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PPARG-201ENST00000287820 SERINC5Q86VE9 423 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 RETREG2Q8NC44 543 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 CAGE1Q8TC20 777 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 GLG1Q92896 1179 aa9.55□□□□□ -0.88
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PPARG-201ENST00000287820 SETD4Q9NVD3 440 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.55□□□□□ -0.88
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PPARG-201ENST00000287820 SCN5AQ14524 2016 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 BTBD18B2RXH4 712 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 TREHO43280 583 aa9.55□□□□□ -0.88
PPARG-201ENST00000287820 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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