RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 MOXD1Q6UVY6 613 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 SLFN12Q8IYM2 578 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 SCFD1Q8WVM8 642 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 CAVIN3Q969G5 261 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 CCDC17Q96LX7 622 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 MBOAT7Q96N66 472 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 EMILIN3Q9NT22 766 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 AIPL1Q9NZN9 384 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 RIMBP2O15034 1052 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 CYP11B2P19099 503 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 KCTD1Q719H9 257 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 GJA10Q969M2 543 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa30.83■■■□□ 2.53
UBP1-201ENST00000283628 MYO1CO00159 1063 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 BUB1O43683 1085 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP30.82■■■□□ 2.523e-7■■■■■ 36.3
UBP1-201ENST00000283628 NNTQ13423 1086 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 PSMB7Q99436 277 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 EHD4Q9H223 541 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D7Q9P0N9 293 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6CA6NDK9 693 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA8KD6RF30 607 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6DP0CG33 693 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 ALS2CLQ60I27 953 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 NELFCDQ8IXH7 590 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 SH3GL2Q99962 352 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa30.82■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 POTEB3A0JP26 581 aa30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 GRID2IPA4D2P6 1211 aa30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 POTECB2RU33 542 aa30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 OPA1O60313 960 aa30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 MSL1Q68DK7 614 aa30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 POTEBQ6S5H4 581 aa30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 KIF13BQ9NQT8 1826 aa30.81■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 CETN3O15182 167 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 PPFIA4O75335 1185 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 CLSTN1O94985 981 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 EPS15P42566 896 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 MCTP2Q6DN12 878 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 GPIHBP1Q8IV16 184 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 CERS5Q8N5B7 392 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 F8W031 263 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 SLC7A5Q01650 507 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 AP3B2Q13367 1082 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 ADAM9Q13443 819 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 ANO3Q9BYT9 981 aa30.8■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 SLC12A3P55017 1021 aa30.79■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 PPFIA1Q13136 1202 aa30.79■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 HHIPL2Q6UWX4 724 aa30.79■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D5Q92609 795 aa30.79■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 GANQ9H2C0 597 aa30.79■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 EHD2Q9NZN4 543 aa30.79■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 PALMO75781 387 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 KRT18P05783 430 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 EPB41P11171 864 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 RAPGEF1Q13905 1077 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 ASIC2Q16515 512 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 QRICH1Q2TAL8 776 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 C10orf76Q5T2E6 689 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 GBP6Q6ZN66 633 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 IFT20Q8IY31 132 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 DCAF4Q8WV16 495 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 LCMT1Q9UIC8 334 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 BTNL10A8MVZ5 291 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 USP17L15C9J2P7 530 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 USP17L13C9JLJ4 530 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 USP17L11C9JVI0 530 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 USP17L18D6R9N7 530 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 USP17L22D6RA61 530 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 USP17L17D6RBQ6 530 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 USP17L19D6RCP7 530 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 USP17L20D6RJB6 530 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 KLHL30Q0D2K2 578 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 USP17L24Q0WX57 530 aa30.78■■■□□ 2.52
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UBP1-201ENST00000283628 USP17L6PQ6QN14 398 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa30.78■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa30.77■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 MEI1Q5TIA1 1274 aa30.77■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 RASSF4Q9H2L5 321 aa30.77■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 STK24Q9Y6E0 443 aa30.77■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 TBX3O15119 743 aa30.77■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 MED24O75448 989 aa30.77■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 ARSHQ5FYA8 562 aa30.77■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 FOXR1Q6PIV2 292 aa30.77■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 MKL1Q969V6 931 aa30.77■■■□□ 2.52
UBP1-201ENST00000283628 KLRC1P26715 233 aa30.76■■■□□ 2.51
UBP1-201ENST00000283628 KCNH2Q12809 1159 aa30.76■■■□□ 2.51
UBP1-201ENST00000283628 FRMD5Q7Z6J6 570 aa30.76■■■□□ 2.51
UBP1-201ENST00000283628 ERMNQ8TAM6 284 aa30.76■■■□□ 2.51
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