RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270560.3

TM4SF5-201, Transcript of transmembrane 4 L six family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM4SF5, Length 708 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5-201ENST00000270560 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.54■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 TNFRSF25Q93038 417 aa23.54■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 MBOAT7Q96N66 472 aa23.54■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.54■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa23.54■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 BTBD18B2RXH4 712 aa23.53■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.53■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 BADQ92934 168 aa23.53■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 KIF3AQ9Y496 699 aa23.53■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 MSH4O15457 936 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 ATG7O95352 703 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 TDP2O95551 362 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 PTGISQ16647 500 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 LETM2Q2VYF4 491 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 TRIM50Q86XT4 487 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 HIPK3Q9H422 1215 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 NOD1Q9Y239 953 aa23.52■■□□□ 1.36
TM4SF5-201ENST00000270560 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 LGR5O75473 907 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 CCNE2O96020 404 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 GUCY1B3Q02153 619 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 GLG1Q92896 1179 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC5A5Q92911 643 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 RIT2Q99578 217 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 AZI2Q9H6S1 392 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 EMSYQ7Z589 1322 aa23.51■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 CYP2C9P11712 490 aa23.5■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 KRT76Q01546 638 aa23.5■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 MFSD5Q6N075 450 aa23.5■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 UIMC1Q96RL1 719 aa23.5■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.5■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 A0A1W2PPC1 479 aa23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 HOXC8P31273 242 aa23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 ABHD15Q6UXT9 468 aa23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 PCYT2Q99447 389 aa23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 FAM205CA6NFA0 338 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 GAS7O60861 476 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 GNAT1P11488 350 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 FPGSQ05932 587 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 TMEM199Q8N511 208 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.48■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 PITPNM1O00562 1244 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC37A4O43826 429 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 CYP2C18P33260 490 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 SLC26A2P50443 739 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 STAT5BP51692 787 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 BFSP2Q13515 415 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 CAGE1Q8TC20 777 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.47■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 WDR64B1ANS9 1081 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 BACH1O14867 736 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 PSMD10O75832 226 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 MARK3P27448 753 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 GJB2P29033 226 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 PTK7Q13308 1070 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 CUL4AQ13619 759 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 HIC1Q14526 733 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 NRCAMQ92823 1304 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 FAM20AQ96MK3 541 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.46■■□□□ 1.35
TM4SF5-201ENST00000270560 TBX3O15119 743 aa23.45■■□□□ 1.34
TM4SF5-201ENST00000270560 PSAPP07602 524 aa23.45■■□□□ 1.34
TM4SF5-201ENST00000270560 SFNP31947 248 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms