RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000194810.5

Vamp4-208, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 4, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Vamp4, Length 600 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ybx2	Q9Z2C8	360 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Rhox3c	A2AWM0	215 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	1600015I10Rik	E9Q745	711 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Dgkk	E9Q7N4	1118 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Evi5l	H3BKQ3	813 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Prkca	P20444	672 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Txk	P42682	527 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Dsc1	P55849	886 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Dhrs11	Q3U0B3	260 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tmem65	Q4VAE3	234 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tshz1	Q5DTH5	1084 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Epha10	Q8BYG9	1007 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Kcnmb1	Q8CAE3	191 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Coq9	Q8K1Z0	313 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Utp4	Q8R2N2	686 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Pip4k2c	Q91XU3	421 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Smurf1	Q9CUN6	731 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Manf	Q9CXI5	179 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Fam187a	Q9D3R5	417 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Speer4b	Q9D9F7	267 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Serpinb9b	Q9DAV6	377 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Clcn2	Q9R0A1	908 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Edar	Q9R187	448 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tfeb	Q9R210	475 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tnks	Q6PFX9	1320 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Igkv4-54	A0A0G2JES9	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gm5795	E9PZN8	263 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	2010300C02Rik	E9Q3M9	1175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gm3248	K7N721	186 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gm3187	M0QWW3	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Dtnb	O70585	659 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Apaf1	O88879	1249 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Col8a1	Q00780	744 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	H2-T22	Q31615	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Eif1ad	Q3THJ3	170 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Pex1	Q5BL07	1284 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Slc5a6	Q5U4D8	634 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Sema4b	Q62179	823 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Smad2	Q62432	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Kcmf1	Q80UY2	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Afap1	Q80YS6	731 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Slc41a1	Q8BJA2	512 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Spon2	Q8BMS2	330 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Slc43a1	Q8BSM7	564 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Unc119b	Q8C4B4	251 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Plekhh3	Q8VCE9	796 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Rnf112	Q96DY5	654 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Kbtbd12	Q9D618	625 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Chit1	Q9D7Q1	464 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810		Q9D9S1	216 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Nacc2	Q9DCM7	586 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Vmn1r40	Q9EQ46	310 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Add2	Q9QYB8	725 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Sema6c	Q9WTM3	931 aa		4.36	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mndal	D0QMC3	538 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gm5093	E9PZB3	174 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Bcat2	O35855	393 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Grap2	O89100	322 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Glrb	P48168	496 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Hhla1	Q3TYV2	514 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Odr4	Q4PJX1	447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Arhgef15	Q5FWH6	849 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mapre3	Q6PER3	281 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tas2r104	Q7M723	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Zswim6	Q80TB7	1207 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Crybg3	Q80W49	1005 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Fam205c	Q80YD3	371 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Csgalnact1	Q8BJQ9	530 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Larp4	Q8BWW4	719 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Slitrk6	Q8C110	840 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Podxl2	Q8CAE9	603 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Irak2	Q8CFA1	622 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Wdr24	Q8CFJ9	790 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Slc14a2	Q8R4T9	930 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gpsm2	Q8VDU0	679 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Olfr806	Q8VFI2	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Lpgat1	Q91YX5	370 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Lpin3	Q99PI4	848 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Vmn1r44	Q9EQ47	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	C1qtnf3	Q9ES30	246 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Plod3	Q9R0E1	741 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ccni	Q9Z2V9	377 aa		4.35	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Usp36	B1AQJ2	1098 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Igsf23	B2RTN2	239 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tnfrsf18	O35714	228 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mtco1	P00397	514 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tp53	P02340	387 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Nkx3-2	P97503	333 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Sirpa	P97797	513 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Lmf1	Q3U3R4	574 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Zdhhc20	Q5Y5T1	380 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Slc6a3	Q61327	619 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Rbm38	Q62176	237 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Dync1li2	Q6PDL0	492 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Taf1c	Q6PDZ2	836 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Fchsd1	Q6PFY1	688 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Lmbrd2	Q8C561	694 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Hectd2	Q8CDU6	774 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Cd276	Q8VE98	316 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Slc6a19	Q9D687	634 aa		4.34	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.8 ms