Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,17■■■■□ 3,22
Sema6cQ9WTM3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sema6cQ9WTM3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Sema6cQ9WTM3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Sema6cQ9WTM3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Sema6cQ9WTM3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Sema6cQ9WTM3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Sema6cQ9WTM3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
Sema6cQ9WTM3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Sema6cQ9WTM3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Sema6cQ9WTM3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,95■■■□□ 2,38
Sema6cQ9WTM3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Sema6cQ9WTM3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,32
Sema6cQ9WTM3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Sema6cQ9WTM3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Sema6cQ9WTM3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Sema6cQ9WTM3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sema6cQ9WTM3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Sema6cQ9WTM3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Sema6cQ9WTM3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Sema6cQ9WTM3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Sema6cQ9WTM3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Sema6cQ9WTM3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Sema6cQ9WTM3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Sema6cQ9WTM3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Sema6cQ9WTM3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Sema6cQ9WTM3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Sema6cQ9WTM3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Sema6cQ9WTM3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Sema6cQ9WTM3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Sema6cQ9WTM3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Sema6cQ9WTM3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Sema6cQ9WTM3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Sema6cQ9WTM3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Sema6cQ9WTM3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Sema6cQ9WTM3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Sema6cQ9WTM3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Sema6cQ9WTM3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Sema6cQ9WTM3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Sema6cQ9WTM3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Sema6cQ9WTM3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Sema6cQ9WTM3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Sema6cQ9WTM3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Sema6cQ9WTM3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Sema6cQ9WTM3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Sema6cQ9WTM3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Sema6cQ9WTM3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Sema6cQ9WTM3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Sema6cQ9WTM3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Sema6cQ9WTM3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Sema6cQ9WTM3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Sema6cQ9WTM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Sema6cQ9WTM3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Sema6cQ9WTM3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Sema6cQ9WTM3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Sema6cQ9WTM3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Sema6cQ9WTM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Sema6cQ9WTM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Sema6cQ9WTM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Sema6cQ9WTM3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sema6cQ9WTM3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Sema6cQ9WTM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Sema6cQ9WTM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Sema6cQ9WTM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Sema6cQ9WTM3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Sema6cQ9WTM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Sema6cQ9WTM3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Sema6cQ9WTM3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Sema6cQ9WTM3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Sema6cQ9WTM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Sema6cQ9WTM3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Sema6cQ9WTM3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Sema6cQ9WTM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Sema6cQ9WTM3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Sema6cQ9WTM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Sema6cQ9WTM3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Sema6cQ9WTM3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Sema6cQ9WTM3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Sema6cQ9WTM3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Sema6cQ9WTM3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Sema6cQ9WTM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Sema6cQ9WTM3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Sema6cQ9WTM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Sema6cQ9WTM3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Sema6cQ9WTM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Sema6cQ9WTM3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Sema6cQ9WTM3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Sema6cQ9WTM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Sema6cQ9WTM3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Sema6cQ9WTM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Sema6cQ9WTM3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Sema6cQ9WTM3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Sema6cQ9WTM3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Sema6cQ9WTM3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Sema6cQ9WTM3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Sema6cQ9WTM3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Sema6cQ9WTM3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Sema6cQ9WTM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,6 ms