Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Smurf1Q9CUN6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Smurf1Q9CUN6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Smurf1Q9CUN6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smurf1Q9CUN6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Smurf1Q9CUN6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Smurf1Q9CUN6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smurf1Q9CUN6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smurf1Q9CUN6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smurf1Q9CUN6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smurf1Q9CUN6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smurf1Q9CUN6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smurf1Q9CUN6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smurf1Q9CUN6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smurf1Q9CUN6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smurf1Q9CUN6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smurf1Q9CUN6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smurf1Q9CUN6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smurf1Q9CUN6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smurf1Q9CUN6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Smurf1Q9CUN6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Smurf1Q9CUN6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smurf1Q9CUN6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smurf1Q9CUN6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smurf1Q9CUN6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smurf1Q9CUN6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smurf1Q9CUN6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Smurf1Q9CUN6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smurf1Q9CUN6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smurf1Q9CUN6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smurf1Q9CUN6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Smurf1Q9CUN6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smurf1Q9CUN6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smurf1Q9CUN6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Smurf1Q9CUN6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smurf1Q9CUN6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smurf1Q9CUN6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smurf1Q9CUN6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Smurf1Q9CUN6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smurf1Q9CUN6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smurf1Q9CUN6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smurf1Q9CUN6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smurf1Q9CUN6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smurf1Q9CUN6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smurf1Q9CUN6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smurf1Q9CUN6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smurf1Q9CUN6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smurf1Q9CUN6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smurf1Q9CUN6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smurf1Q9CUN6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smurf1Q9CUN6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smurf1Q9CUN6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smurf1Q9CUN6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smurf1Q9CUN6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smurf1Q9CUN6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smurf1Q9CUN6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smurf1Q9CUN6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smurf1Q9CUN6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smurf1Q9CUN6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smurf1Q9CUN6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smurf1Q9CUN6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smurf1Q9CUN6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smurf1Q9CUN6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smurf1Q9CUN6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smurf1Q9CUN6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smurf1Q9CUN6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smurf1Q9CUN6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smurf1Q9CUN6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smurf1Q9CUN6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smurf1Q9CUN6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smurf1Q9CUN6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smurf1Q9CUN6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smurf1Q9CUN6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smurf1Q9CUN6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smurf1Q9CUN6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smurf1Q9CUN6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smurf1Q9CUN6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smurf1Q9CUN6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smurf1Q9CUN6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smurf1Q9CUN6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smurf1Q9CUN6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Smurf1Q9CUN6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smurf1Q9CUN6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smurf1Q9CUN6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smurf1Q9CUN6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smurf1Q9CUN6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smurf1Q9CUN6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smurf1Q9CUN6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smurf1Q9CUN6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smurf1Q9CUN6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smurf1Q9CUN6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smurf1Q9CUN6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smurf1Q9CUN6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smurf1Q9CUN6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smurf1Q9CUN6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smurf1Q9CUN6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smurf1Q9CUN6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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