Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,83■■■■□ 3,01
Slc5a6Q5U4D8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Slc5a6Q5U4D8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Slc5a6Q5U4D8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Slc5a6Q5U4D8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Slc5a6Q5U4D8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Slc5a6Q5U4D8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Slc5a6Q5U4D8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Slc5a6Q5U4D8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Slc5a6Q5U4D8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Slc5a6Q5U4D8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Slc5a6Q5U4D8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Slc5a6Q5U4D8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Slc5a6Q5U4D8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Slc5a6Q5U4D8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Slc5a6Q5U4D8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Slc5a6Q5U4D8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Slc5a6Q5U4D8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Slc5a6Q5U4D8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Slc5a6Q5U4D8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Slc5a6Q5U4D8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Slc5a6Q5U4D8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Slc5a6Q5U4D8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Slc5a6Q5U4D8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Slc5a6Q5U4D8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Slc5a6Q5U4D8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Slc5a6Q5U4D8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Slc5a6Q5U4D8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Slc5a6Q5U4D8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Slc5a6Q5U4D8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
Slc5a6Q5U4D8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Slc5a6Q5U4D8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Slc5a6Q5U4D8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Slc5a6Q5U4D8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Slc5a6Q5U4D8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Slc5a6Q5U4D8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Slc5a6Q5U4D8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Slc5a6Q5U4D8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Slc5a6Q5U4D8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Slc5a6Q5U4D8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Slc5a6Q5U4D8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Slc5a6Q5U4D8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Slc5a6Q5U4D8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Slc5a6Q5U4D8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Slc5a6Q5U4D8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Slc5a6Q5U4D8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Slc5a6Q5U4D8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,66■■□□□ 1,86
Slc5a6Q5U4D8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Slc5a6Q5U4D8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
Slc5a6Q5U4D8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Slc5a6Q5U4D8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Slc5a6Q5U4D8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Slc5a6Q5U4D8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Slc5a6Q5U4D8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Slc5a6Q5U4D8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Slc5a6Q5U4D8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Slc5a6Q5U4D8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Slc5a6Q5U4D8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
Slc5a6Q5U4D8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Slc5a6Q5U4D8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Slc5a6Q5U4D8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Slc5a6Q5U4D8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Slc5a6Q5U4D8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,2■■□□□ 1,79
Slc5a6Q5U4D8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Slc5a6Q5U4D8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Slc5a6Q5U4D8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Slc5a6Q5U4D8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Slc5a6Q5U4D8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Slc5a6Q5U4D8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
Slc5a6Q5U4D8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Slc5a6Q5U4D8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Slc5a6Q5U4D8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Slc5a6Q5U4D8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Slc5a6Q5U4D8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Slc5a6Q5U4D8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Slc5a6Q5U4D8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Slc5a6Q5U4D8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Slc5a6Q5U4D8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Slc5a6Q5U4D8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Slc5a6Q5U4D8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Slc5a6Q5U4D8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Slc5a6Q5U4D8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Slc5a6Q5U4D8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Slc5a6Q5U4D8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Slc5a6Q5U4D8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Slc5a6Q5U4D8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Slc5a6Q5U4D8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Slc5a6Q5U4D8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Slc5a6Q5U4D8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Slc5a6Q5U4D8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Slc5a6Q5U4D8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Slc5a6Q5U4D8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Slc5a6Q5U4D8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Slc5a6Q5U4D8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms