Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,83■■■■□ 3,81
Dsc1P55849 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Dsc1P55849 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Dsc1P55849 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,02■■■■□ 3,04
Dsc1P55849 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Dsc1P55849 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,59■■■□□ 2,97
Dsc1P55849 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,28■■■□□ 2,92
Dsc1P55849 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Dsc1P55849 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Dsc1P55849 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Dsc1P55849 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Dsc1P55849 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Dsc1P55849 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,45■■■□□ 2,79
Dsc1P55849 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Dsc1P55849 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Dsc1P55849 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Dsc1P55849 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Dsc1P55849 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Dsc1P55849 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,42■■■□□ 2,62
Dsc1P55849 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,61
Dsc1P55849 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Dsc1P55849 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Dsc1P55849 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Dsc1P55849 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Dsc1P55849 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Dsc1P55849 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Dsc1P55849 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Dsc1P55849 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Dsc1P55849 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Dsc1P55849 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Dsc1P55849 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Dsc1P55849 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Dsc1P55849 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Dsc1P55849 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Dsc1P55849 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,62■■■□□ 2,49
Dsc1P55849 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Dsc1P55849 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Dsc1P55849 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Dsc1P55849 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Dsc1P55849 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Dsc1P55849 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Dsc1P55849 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Dsc1P55849 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Dsc1P55849 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Dsc1P55849 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Dsc1P55849 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Dsc1P55849 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Dsc1P55849 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Dsc1P55849 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Dsc1P55849 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Dsc1P55849 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Dsc1P55849 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Dsc1P55849 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Dsc1P55849 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Dsc1P55849 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Dsc1P55849 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Dsc1P55849 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Dsc1P55849 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Dsc1P55849 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Dsc1P55849 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Dsc1P55849 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Dsc1P55849 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Dsc1P55849 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Dsc1P55849 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Dsc1P55849 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Dsc1P55849 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Dsc1P55849 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Dsc1P55849 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Dsc1P55849 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Dsc1P55849 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Dsc1P55849 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Dsc1P55849 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Dsc1P55849 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Dsc1P55849 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Dsc1P55849 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Dsc1P55849 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Dsc1P55849 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Dsc1P55849 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Dsc1P55849 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Dsc1P55849 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Dsc1P55849 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Dsc1P55849 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Dsc1P55849 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Dsc1P55849 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Dsc1P55849 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Dsc1P55849 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Dsc1P55849 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Dsc1P55849 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Dsc1P55849 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Dsc1P55849 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Dsc1P55849 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Dsc1P55849 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Dsc1P55849 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Dsc1P55849 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Dsc1P55849 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Dsc1P55849 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Dsc1P55849 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Dsc1P55849 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Dsc1P55849 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Dsc1P55849 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,9 ms