RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ankrd35E9Q9D8 996 aa22.75■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcm5P49718 733 aa22.75■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pnma5Q5DTT8 618 aa22.75■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif3j2Q66JS6 263 aa22.75■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt79Q8VED5 531 aa22.75■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nck2O55033 380 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r209Q5NC97 312 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf428Q8C1M2 176 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kbtbd13Q8C828 458 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Spata2Q8K004 515 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt82Q99M74 516 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acot3Q9QYR7 432 aa22.74■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 PnocQ64387 187 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LdhdQ7TNG8 484 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rufy1Q8BIJ7 712 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kbtbd4Q8R179 534 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gbp7Q91Z40 638 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nxnl2Q9D531 156 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cd274Q9EP73 290 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prkab1Q9R078 270 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Glt1d1A4FUP9 346 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gngt1Q61012 74 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vil1Q62468 827 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt87Q6IMF0 495 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tmem39bQ810L4 492 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpsm2Q8VDU0 679 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zkscan3Q91VW9 553 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Grin3bQ91ZU9 1003 aa22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rsbn1lD3Z0K6 821 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lig1P37913 916 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Klrg2Q3UM83 387 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Naa15Q80UM3 865 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q8BWG4 1187 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BlmhQ8R016 455 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tgm5Q9D7I9 724 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 LrmdaQ9D9B4 229 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fmnl1Q9JL26 1094 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SynrgQ5SV85 1306 aa22.72■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Map7d1A2AJI0 846 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 OatP29758 439 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cap1P40124 474 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pdrg1P59048 133 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cyp2e1Q05421 493 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 BC048507Q80ZS7 89 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plcg2Q8CIH5 1265 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pak2Q8CIN4 524 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cgref1Q8R1U2 281 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aipl1Q924K1 328 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NrapQ80XB4 1728 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm4985A2ALC6 410 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prl2c3P04768 224 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CfhP06909 1234 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tsg101Q61187 391 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc9b1Q8C0X2 565 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Smc6Q924W5 1097 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt34Q9D646 392 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MycbpQ9EQS3 103 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Azi2Q9QYP6 405 aa22.71■■□□□ 1.23
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dnaaf5B9EJR8 853 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 C2cd2E9Q3C1 696 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nedd1P33215 660 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gfpt1P47856 697 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Wnt10bP48614 389 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fam107bQ3TGF2 131 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5169Q5M8P2 212 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gas8Q60779 478 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Scfd2Q8BTY8 684 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Alg1Q921Q3 482 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 GrapQ9CX99 217 aa22.7■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lmnb2P21619 596 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Capza3P70190 299 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Acsbg2Q2XU92 667 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kcnj11Q61743 390 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Usp27Q8CEG8 438 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Depdc1aQ8CIG0 804 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Oxnad1Q8VE38 311 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 March8Q9DBD2 286 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 EhhadhQ9DBM2 718 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atrnl1Q6A051 1378 aa22.69■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 XlrP05531 208 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mmp14P53690 582 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa22.68■■□□□ 1.22
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.6 ms