RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem192Q9CXT7 266 aa13.03□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sucla2Q9Z2I9 463 aa13.03□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rabgap1A2AWA9 1064 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Skor2A7M7C7 1008 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gcnt4E9Q649 455 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Barx2O08686 283 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina1aP07758 413 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina1bP22599 413 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Akr1b1P45376 316 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina1cQ00896 412 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina1dQ00897 413 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ecm1Q61508 559 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mbtps2Q8CHX6 515 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpap2Q8VC34 614 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmd2Q8VDM4 908 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Got1P05201 413 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Actr2P61161 394 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pbxip1Q3TVI8 727 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Moxd2Q7TT41 619 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snap47Q8R570 413 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nudt5Q9JKX6 218 aa13.02□□□□□ -0.32
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pgap3A2A559 320 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp984A2A7A2 547 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 TazI7HJS2 263 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tpm1P58771 284 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r13bQ62415 1087 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syce1Q9D495 329 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olr1Q9EQ09 363 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef7Q9ES28 862 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mkrn1Q9QXP6 481 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb12Q9Z150 459 aa13.02□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trappc11B2RXC1 1133 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r79E9Q067 851 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmigd3G3X8R9 209 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pip4k2aO70172 405 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stra6O70491 670 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Etv6P97360 485 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kmt5aQ2YDW7 349 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rsad1Q5SUV1 442 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Raver2Q7TPD6 673 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pxylp1Q8BHA9 480 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrpl58Q8R035 206 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf6lQ8R2K4 616 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zcchc18Q8VD24 393 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpap3Q9D706 660 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gjd2O54851 321 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Msh3P13705 1091 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 StamP70297 548 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Miga1Q4QQM5 600 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igbp1Q61249 340 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hook2Q7TMK6 716 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Setdb2Q8C267 713 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nrbp2Q91V36 499 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mis18aQ9CZJ6 204 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prom1O54990 867 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc16a2O70324 545 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrgprb1Q3UG61 350 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gja3Q64448 417 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem63cQ8CBX0 802 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ctu1Q99J10 420 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nudt12Q9DCN1 462 aa13.01□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kansl1lQ5DTI6 991 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Anp32cQ64G17 123 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ece2Q80Z60 881 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 OtoaQ8K561 1137 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf687Q9D2D7 1237 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 CoasyQ9DBL7 563 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r78K7N6U5 853 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp11b2P15539 500 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcna2P63141 499 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pank2Q3U4S0 443 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 E2f8Q58FA4 860 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ces1eQ64176 562 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdc14aQ6GQT0 603 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adck2Q6NSR3 617 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dhx37Q6NZL1 1150 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taok2Q6ZQ29 1240 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Txndc5Q91W90 417 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcdha7Q91Y13 937 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ranbp17Q99NF8 1088 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Galnt15Q9D2N8 638 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 UgcgO88693 394 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pgk2P09041 417 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf1bP97358 586 aa13□□□□□ -0.33
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3414Q3TNU4 584 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57 ms