Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
Serpina1cQ00896 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Serpina1cQ00896 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Serpina1cQ00896 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Serpina1cQ00896 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Serpina1cQ00896 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Serpina1cQ00896 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Serpina1cQ00896 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Serpina1cQ00896 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Serpina1cQ00896 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Serpina1cQ00896 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Serpina1cQ00896 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Serpina1cQ00896 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Serpina1cQ00896 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Serpina1cQ00896 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Serpina1cQ00896 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Serpina1cQ00896 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Serpina1cQ00896 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Serpina1cQ00896 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Serpina1cQ00896 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Serpina1cQ00896 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Serpina1cQ00896 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Serpina1cQ00896 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Serpina1cQ00896 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Serpina1cQ00896 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Serpina1cQ00896 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Serpina1cQ00896 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Serpina1cQ00896 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Serpina1cQ00896 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Serpina1cQ00896 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Serpina1cQ00896 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Serpina1cQ00896 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Serpina1cQ00896 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Serpina1cQ00896 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Serpina1cQ00896 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Serpina1cQ00896 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Serpina1cQ00896 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Serpina1cQ00896 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Serpina1cQ00896 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Serpina1cQ00896 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Serpina1cQ00896 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Serpina1cQ00896 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Serpina1cQ00896 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Serpina1cQ00896 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Serpina1cQ00896 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Serpina1cQ00896 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Serpina1cQ00896 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Serpina1cQ00896 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Serpina1cQ00896 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Serpina1cQ00896 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Serpina1cQ00896 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Serpina1cQ00896 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Serpina1cQ00896 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Serpina1cQ00896 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Serpina1cQ00896 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Serpina1cQ00896 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Serpina1cQ00896 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Serpina1cQ00896 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Serpina1cQ00896 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Serpina1cQ00896 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Serpina1cQ00896 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Serpina1cQ00896 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Serpina1cQ00896 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Serpina1cQ00896 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Serpina1cQ00896 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Serpina1cQ00896 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Serpina1cQ00896 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Serpina1cQ00896 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Serpina1cQ00896 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Serpina1cQ00896 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Serpina1cQ00896 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Serpina1cQ00896 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Serpina1cQ00896 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Serpina1cQ00896 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Serpina1cQ00896 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Serpina1cQ00896 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Serpina1cQ00896 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Serpina1cQ00896 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Serpina1cQ00896 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Serpina1cQ00896 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Serpina1cQ00896 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Serpina1cQ00896 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Serpina1cQ00896 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Serpina1cQ00896 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Serpina1cQ00896 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Serpina1cQ00896 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Serpina1cQ00896 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Serpina1cQ00896 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Serpina1cQ00896 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Serpina1cQ00896 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Serpina1cQ00896 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Serpina1cQ00896 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Serpina1cQ00896 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Serpina1cQ00896 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Serpina1cQ00896 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Serpina1cQ00896 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Serpina1cQ00896 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Serpina1cQ00896 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Serpina1cQ00896 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Serpina1cQ00896 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms