RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C OCA4P25366 362 aa6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C ARE1P25628 610 aa6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C SPO23P33757 523 aa6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C MIA40P36046 403 aa6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C MUD2P36084 527 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C TPA1P40032 644 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C SNO3P43544 222 aa6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C ARC1P46672 376 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C PMT4P46971 762 aa6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C LIA1P47120 325 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C YJR115WP47152 169 aa6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C BPL1P48445 690 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C MLH3Q12083 715 aa6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C BLM10P43583 2143 aa6.49□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C HXK2P04807 486 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C COS2P0CX12 379 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C COS3P0CX13 379 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C YCL042WP25572 119 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C PTR2P32901 601 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C SEC61P32915 480 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C SEA4P38164 1038 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C TAT2P38967 592 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C GIP2P40036 548 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C MET18P40469 1032 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C YIL067CP40514 678 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C COS4P43542 379 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C ALB1P47019 175 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C PBP1P53297 722 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C UBX4P54730 416 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C IRC15Q02733 499 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C YPL068CQ02749 293 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C MET31Q03081 177 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C YOR019WQ99248 730 aa6.48□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C DST1P07273 309 aa6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C CBS2P14905 389 aa6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C SYP1P25623 870 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C IDH2P28241 369 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C ATG7P38862 630 aa6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C NAS6P50086 228 aa6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C YSA1Q01976 231 aa6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C YPR172WQ06608 200 aa6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C ESA1Q08649 445 aa6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C YOR365CQ08844 703 aa6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C TMA46Q12000 345 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C SPE4Q12455 300 aa6.47□□□□□ -1.37
SPE3YPR069C ARG4P04076 463 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C SRV2P17555 526 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C KRE6P32486 720 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C MSN2P33748 704 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C DHR2P36009 735 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C TRR2P38816 342 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C TDA11P38854 504 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PFK26P40433 827 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C PKP1P40530 394 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C TED1P40533 473 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C MEP2P41948 499 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C IRC6P43615 237 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C FAR3P46671 204 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YJL043WP47053 257 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ATP22P50273 684 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C MUP1P50276 574 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C NOP19P53317 196 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C MSC1Q03104 513 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YDR124WQ04608 324 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C COX17Q12287 69 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C NTO1Q12311 748 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YOS9Q99220 542 aa6.46□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YPR096CO13587 100 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C DAP2P18962 818 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C AUR1P36107 401 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C BET3P36149 193 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ECO1P43605 281 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C APS3P47064 194 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C EMC2P47133 292 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C UPF3P48412 387 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C IDP3P53982 420 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YPL071CQ02864 156 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YDR541CQ03049 344 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C ECM11Q04110 302 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C SMA2Q04658 369 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YPR091CQ06833 770 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YVC1Q12324 675 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa6.45□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C BPH1P25356 2167 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C CTS1P29029 562 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C YSC84P32793 468 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C LHS1P36016 881 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C CAF4P36130 643 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C COS111P38308 924 aa6.44□□□□□ -1.38
SPE3YPR069C LIN1P38852 340 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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