RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W FKH2P41813 862 aa4.55□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PTR3P43606 678 aa4.55□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W IRC6P43615 237 aa4.55□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W LOH1P47055 219 aa4.55□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YLR345WQ06137 509 aa4.55□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W CDC36P06100 191 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W STE12P13574 688 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W TAL1P15019 335 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PRP19P32523 503 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W TDP1P38319 544 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PCL5P38794 229 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W GIM4P40005 111 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W EMP65P40085 556 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PIG2P40187 538 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YJL068CP40363 299 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W UPF3P48412 387 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YGR053CP53234 283 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W TIM10P87108 93 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.54□□□□□ -1.68not detected
YMR196WYMR196W YPL107WQ02873 248 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YHM2Q04013 314 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PPN1Q04119 674 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W HFD1Q04458 532 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W ECM18Q04623 453 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W COS2P0CX12 379 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W COS3P0CX13 379 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PHO81P17442 1178 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YCK2P23292 546 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W SDH8P38345 138 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W OSH7P38755 437 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W MED6P38782 295 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W NPT1P39683 429 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W GIP4P39732 760 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W COS4P43542 379 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W NAS6P50086 228 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W GPG1P53130 126 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W COS6P53344 381 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W VTA1Q06263 330 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W DXO1Q06349 442 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YOR012WQ12351 137 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W SAS5Q99314 248 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YAR066WP0CX18 203 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YHR214WP0CX19 203 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W URA4P20051 364 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W FPR1P20081 114 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W GIT1P25346 518 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W SGF29P25554 259 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W TFC1P32367 649 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YBL010CP32788 280 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W ATO2P32907 282 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W AST1P35183 429 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W SUR2P38992 349 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W HXT6P39003 570 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W HXT7P39004 570 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W GPP2P40106 250 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W DIM1P41819 318 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YPT32P51996 222 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YPQ2Q06328 317 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W TGL5Q12043 749 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W TGS1Q12052 315 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W HUA2Q12134 243 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PST1Q12355 444 aa4.54□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W CDC21P06785 304 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W TUB1P09733 447 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W AAC3P18238 307 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W RVS161P25343 265 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W HSP30P25619 332 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W NPL6P32832 435 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YKL097CP34245 136 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W PDX3P38075 228 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W SSO2P39926 295 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W ICE2P40499 491 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W SER33P40510 469 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W BNA3P47039 444 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W NPY1P53164 384 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W CWC24P53769 259 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W HSP31Q04432 237 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W VPS74Q06385 345 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data4.53□□□□□ -1.68not detected
YMR196WYMR196W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data4.53□□□□□ -1.68not detected
YMR196WYMR196W RTR2Q12378 196 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W GTT2Q12390 233 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W HMS1Q12398 434 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W SKM1Q12469 655 aa4.53□□□□□ -1.68
YMR196WYMR196W HXK2P04807 486 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.9 ms