RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W MAK32P23060 363 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W HXT3P32466 567 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W AEP1P32493 518 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SAC6P32599 642 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RPC25P35718 212 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W KES1P35844 434 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W DBP8P38719 431 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YHR182WP38870 785 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W ATM1P40416 690 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W SCW4P53334 386 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W ESF2P53743 316 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W INN1P53901 409 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RRN11Q04712 507 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W CIA1Q05583 330 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W TPO3Q06451 622 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W PGC1Q08959 321 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W YOR342CQ12182 319 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W Q0010Q9ZZX9 128 aa2.09□□□□□ -2.07
SSQ1YLR369W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YER190C-BP0CX94 160 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YEL077W-AP0CX95 160 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YGR296C-BP0CX96 160 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YPL283W-BP0CX97 160 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YPR204C-AP0CX98 160 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YCR061WP25639 631 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W DBF20P32328 564 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W SPC110P32380 944 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W SWC5P38326 303 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W STN1P38960 494 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ERP2P39704 215 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ARB1P40024 610 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ERR3P42222 437 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W STB2P46679 850 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YJL132WP47014 750 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W COG2P53271 262 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YDR222WQ04925 415 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W BLS1Q06071 122 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W TEN1Q07921 160 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YER175W-AQ8TGU4 54 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W IZH4Q99393 312 aa2.09□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W CPA1P07258 411 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W FUR1P18562 216 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W AMD2P22580 549 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W CLB4P24871 460 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W DCC1P25559 380 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W KRE6P32486 720 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W SOL2P37262 315 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YBR138CP38277 524 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W DHH1P39517 506 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W SAP1P39955 897 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W IES5P40060 125 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W PUG1P40100 303 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W IRC7P43623 340 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YGR127WP53275 312 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W MRS2Q01926 470 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YPL071CQ02864 156 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W EBS1Q03466 884 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W TDA9Q04545 1251 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W MRPL1Q04599 285 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YOL107WQ12239 342 aa2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W GAL7P08431 366 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YMR085WP0CF18 432 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W BIK1P11709 440 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W CLN1P20437 546 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W TRX1P22217 103 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YCR102CP25608 368 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W COQ3P27680 312 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ARP2P32381 391 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W GND1P38720 489 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W AIM18P38884 321 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YIL024CP40543 189 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YJL107CP42947 387 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W LCL3P53153 274 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W SGF73P53165 657 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W HST1P53685 503 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W GTR1Q00582 310 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ATG21Q02887 496 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W YML119WQ03208 357 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W RCO1Q04779 684 aa2.07□□□□□ -2.08
SSQ1YLR369W RAD34Q06665 692 aa2.07□□□□□ -2.08
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