RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	GCN2	P15442	1659 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RHO2	P06781	192 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	HXT2	P23585	541 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	DAL2	P25335	343 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ECM25	P32525	599 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	FRE1	P32791	686 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.01	□□□□□ -1.77	not detected
SYF1	YDR416W	LHS1	P36016	881 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YHR182W	P38870	785 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GPI16	P38875	610 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CTH1	P47976	325 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YNL260C	P53846	198 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YNL146W	P53906	100 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	URH1	Q04179	340 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YPK2	P18961	677 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	AMD2	P22580	549 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GAC1	P28006	793 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	LAC1	P28496	418 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ZIP1	P31111	875 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YPS1	P32329	569 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	OCT1	P35999	772 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YHR122W	P38829	231 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ALP1	P38971	573 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PLB1	P39105	664 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CIN4	P39110	191 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YFR020W	P43600	232 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TAX4	P47030	604 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RXT3	Q07458	294 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TEN1	Q07921	160 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	LOT6	Q07923	191 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	BSC6	Q08280	497 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ATG31	Q12421	196 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	LAG2	Q92325	660 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CDC21	P06785	304 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MAS1	P10507	462 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SIN4	P32259	974 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	HXT1	P32465	570 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	EMP70	P32802	667 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ECT1	P33412	323 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RPC25	P35718	212 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	KDX1	P36005	433 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CTP1	P38152	299 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	VHC1	P38329	1120 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TSC10	P38342	320 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SPC97	P38863	823 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SPG5	P42933	373 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YLR283W	Q05867	314 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MDM30	Q05930	598 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	BTS1	Q12051	335 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GET4	Q12125	312 aa		4	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	IML3	P38265	245 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MBB1	P39534	108 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RET3	P53600	189 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SHR3	Q02774	210 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CTS2	Q06350	511 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	NSE1	Q07913	336 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YDR262W	Q12331	272 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	NPC2	Q12408	173 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RMD5	Q12508	421 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ABF1	P14164	731 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SPE2	P21182	396 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RHB1	P25378	209 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CWP1	P28319	239 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ELF1	P36053	145 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	FMP33	P46998	180 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YNL092W	P53934	400 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	UBP16	Q02863	499 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PDR8	Q06149	701 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	AI3	P03877	415 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SCEI	P03882	235 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	COR1	P07256	457 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YSC83	P32792	385 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RPC34	P32910	317 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YPT10	P38146	199 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.98	□□□□□ -1.77	not detected
SYF1	YDR416W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ICP55	P40051	511 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YAR1	P46683	200 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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