RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 ODF1Q14990 250 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR19Q15760 415 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCB5Q2M3G0 1257 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 BICRALQ6AI39 1079 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 C14orf80Q86SX3 495 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKLE2Q86XL3 938 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 SPPL2CQ8IUH8 684 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 TOMM22Q9NS69 142 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ADGRE2Q9UHX3 823 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM59LQ9UK28 342 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 DSEQ9UL01 958 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa3.03□□□□□ -1.92
SPTAN1-232ENST00000636483 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLGA8AA7E2F4 631 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 F8W031 263 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 SGSM2O43147 1006 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 AKAP10O43572 662 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 NRDCO43847 1150 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 TADA3O75528 432 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 MT-CO1P00395 513 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 MYBL2P10244 700 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 IARSP41252 1262 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 LSSP48449 732 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 KIF11P52732 1056 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 IRF9Q00978 393 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 DUSP4Q13115 394 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 PDCD1Q15116 288 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 TERF2Q15554 542 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 PTPN21Q16825 1174 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGAP44Q17R89 818 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 SYDE2Q5VT97 1194 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 BTBD8Q5XKL5 378 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 STEAP3Q658P3 488 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 GALNT18Q6P9A2 607 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 EP400NLQ6ZTU2 488 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 OTOP1Q7RTM1 612 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 MILR1Q7Z6M3 343 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 C11orf74Q86VG3 221 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 DTX1Q86Y01 620 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 TP53INP2Q8IXH6 220 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKS4BQ8N8V4 417 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 FLCNQ8NFG4 579 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 SHISA4Q96DD7 197 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 HOOK2Q96ED9 719 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 MISP3Q96FF7 219 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 EPB41L1Q9H4G0 881 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 PDLIM7Q9NR12 457 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 RIC8BQ9NVN3 520 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR160Q9UJ42 338 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 TAF6LQ9Y6J9 622 aa3.02□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 RASSF10A6NK89 507 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 H7C1D1 291 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 ACOT7O00154 380 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 HGSO14964 777 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHGA12O60330 932 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 ULK1O75385 1050 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 PRNPP04156 253 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 GLI4P10075 376 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 FUT4P22083 530 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 CCND1P24385 295 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 CD97P48960 835 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 NEK2P51955 445 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 ERVK-21P61565 698 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 TUSC3Q13454 348 aa3.01□□□□□ -1.93
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP2R5AQ15172 486 aa3.01□□□□□ -1.93
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