RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSWIM5Q9P217 1185 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 NT5C2P49902 561 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0753Q2KHM9 967 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF16Q5VV41 709 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 C7orf31Q8N865 590 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MTMR8Q96EF0 704 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 KAT14Q9H8E8 782 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMC2Q13753 1193 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC178Q5BJE1 867 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCA1Q86XH1 822 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM122AQ96E09 287 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCD2LQ9BRP1 358 aa27.78■■■□□ 2.04
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CAPNS1-216ENST00000628306 AGXT2Q9BYV1 514 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MTUS1Q9ULD2 1270 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 MRVI1Q9Y6F6 885 aa27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SP2Q02086 613 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HSDL1Q3SXM5 330 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 IL31RAQ8NI17 732 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.77■■■□□ 2.04
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CAPNS1-216ENST00000628306 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MICAL3Q7RTP6 2002 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXC8P31273 242 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 NCOA7Q8NI08 942 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 OSBPL7Q9BZF2 842 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB14O75071 495 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 LGR5O75473 907 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 CPA1P15085 419 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 IKBKEQ14164 716 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC23AQ15436 765 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM117BQ6P1L5 589 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SERINC5Q86VE9 423 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 VSIG10LQ86VR7 867 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PPFIA4O75335 1185 aa27.73■■■□□ 2.03
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CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf80Q9BSJ5 609 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MTA3Q9BTC8 594 aa27.73■■■□□ 2.03
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CAPNS1-216ENST00000628306 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MAD2L2Q9UI95 211 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
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CAPNS1-216ENST00000628306 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MCM5P33992 734 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 EVCP57679 992 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM31Q5JXX7 168 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA33Q96N06 139 aa27.72■■■□□ 2.03
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CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.71■■■□□ 2.03
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-216ENST00000628306 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-216ENST00000628306 PI4K2BG5E9Z4 385 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB5O15062 677 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM86C2PA6NEL3 165 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 NUCB2P80303 420 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNV1Q6PIU1 500 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT23Q9C075 422 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 EMSYQ7Z589 1322 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPH10B2B2RC85 870 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPH10BP0C881 870 aa27.68■■■□□ 2.02
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