RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ARSHQ5FYA8 562 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 USP40Q9NVE5 1235 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 FAM196BA6NMK8 535 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 TACC1O75410 805 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MED24O75448 989 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PRLRP16471 622 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 CASP5P51878 434 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 RASSF7Q02833 373 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.77□□□□□ -0.04
C9orf170-201ENST00000623052 AKR1B10O60218 316 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CYP11B2P19099 503 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 GGCXP38435 758 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 DEF6Q9H4E7 631 aa14.77□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 BUB1O43683 1085 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SLC7A5Q01650 507 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ITIH3Q06033 890 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CEP72Q9P209 647 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SWAP70Q9UH65 585 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SCN9AQ15858 1988 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TRAF5O00463 557 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 PLA2G4BP0C869 781 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEA1P43355 309 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 DOK7Q18PE1 504 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SP8Q8IXZ3 490 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MBOAT7Q96N66 472 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TSG101Q99816 390 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 COA1Q9GZY4 146 aa14.76□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 RPS6KA5O75582 802 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 HOXD13P35453 343 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SLC12A3P55017 1021 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MS4A14Q96JA4 679 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 GANQ9H2C0 597 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 POTEFA5A3E0 1075 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 POTEIP0CG38 1075 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 POTEGQ6S5H5 508 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 GPBP1Q86WP2 473 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MEIS2O14770 477 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TOM1O60784 492 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MCM3P25205 808 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CACNB3P54284 484 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 PSMC6P62333 389 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SEPT2Q15019 361 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MAP9Q49MG5 647 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC31Q6UY01 552 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.75□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 LENG9Q96B70 501 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ANO3Q9BYT9 981 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SNAP25P60880 206 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
C9orf170-201ENST00000623052 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms