RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 ICAM3P32942 547 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 THPOP40225 353 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 METTL7BQ6UX53 244 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 MAP4K1Q92918 833 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 COG5Q9UP83 839 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 DDAH1O94760 285 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 RSPH10BP0C881 870 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 SEMA3FQ13275 785 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 NEDD9Q14511 834 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 MAP3K14Q99558 947 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 MYL10Q9BUA6 226 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 LY9Q9HBG7 655 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 KAT6AQ92794 2004 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 LINC01553A4QN01 128 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 FIBPO43427 364 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 USP26Q9BXU7 913 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 TREHO43280 583 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 KIF5BP33176 963 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 ERVK-21P61565 698 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 GPR20Q99678 358 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAF4-216ENST00000586813 PIK3CDO00329 1044 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 AMHP03971 560 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 SMARCA1P28370 1054 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 TRIM50Q86XT4 487 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 CUL5Q93034 780 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 HLA-CQ95604 372 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 MEIS2O14770 477 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 CAND2O75155 1236 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 CASC1Q6TDU7 716 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 MTA3Q9BTC8 594 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 INSL6Q9Y581 213 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 COL4A6Q14031 1691 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 PRC1O43663 620 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 CTSHP09668 335 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 GNAT1P11488 350 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 COL9A1P20849 921 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 SETD4Q9NVD3 440 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 SP4Q02446 784 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 SEPT8Q92599 483 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 MCM5P33992 734 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 GNAQP50148 359 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 NLRX1Q86UT6 975 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM87BQ96K49 555 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.28■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC69A6NI79 296 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 RXRAP19793 462 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 ADAM17P78536 824 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGAP4P98171 946 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 TMTC2Q8N394 836 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAF4-216ENST00000586813 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms