RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	KIF28P	B7ZC32	967 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	CHMP4BP1	P59074	171 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	METTL7B	Q6UX53	244 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	PHF24	Q9UPV7	400 aa		28.29	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PQY0	241 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	PPTC7	Q8NI37	304 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		28.28	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		28.27	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	WDR81	Q562E7	1941 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229		A6NJR5	290 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	EDIL3	O43854	480 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	MARCH6	O60337	910 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	NKX3-2	P78367	333 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	DGKD	Q16760	1214 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	SLC37A4	O43826	429 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF286B	P0CG31	522 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229		Q4G0T1	1027 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	LENG9	Q96B70	501 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	NFASC	O94856	1347 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	MSH4	O15457	936 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	COL6A1	P12109	1028 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	KPNA6	O60684	536 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	SYT1	P21579	422 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	CYP3A7	P24462	503 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	28.23	■■■□□ 2.11	1e-7	■■■□□ 18.2
GPS1-223	ENST00000584229	PSMC6	P62333	389 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	POTED	Q86YR6	584 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	GJA10	Q969M2	543 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	GAS7	O60861	476 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	CABYR	O75952	493 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	FERMT3	Q86UX7	667 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	GPR20	Q99678	358 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	MCM7	P33993	719 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	TTC38	Q5R3I4	469 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	MBOAT7	Q96N66	472 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229	KAT6A	Q92794	2004 aa		28.2	■■■□□ 2.11
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	WNT7A	O00755	349 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	CHMP2A	O43633	222 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	NEMF	O60524	1076 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	DPF3	Q92784	378 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	SAMM50	Q9Y512	469 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	ELP1	O95163	1332 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	STX6	O43752	255 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	PPFIA4	O75335	1185 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	LGALS2	P05162	132 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	ACTR2	P61160	394 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	NBR1	Q14596	966 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF174	Q15697	407 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	CALCRL	Q16602	461 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	SLC5A5	Q92911	643 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	KRT76	Q01546	638 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM50	Q86XT4	487 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GPS1-223	ENST00000584229	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms