RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		32.51	■■■□□ 2.8
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		32.51	■■■□□ 2.8
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		32.51	■■■□□ 2.8
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IL31RA	Q8NI17	732 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	JADE2	Q9NQC1	790 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600		A0A0G2JMZ2	1700 aa		32.51	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	POTEF	A5A3E0	1075 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PTGS1	P23219	599 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	POTEG	Q6S5H5	508 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MOB2	Q70IA6	237 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		32.5	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EML1	O00423	815 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STK4	Q13043	487 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PLS1	Q14651	629 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LBX2	Q6XYB7	198 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CHST13	Q8NET6	341 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC12A3	P55017	1021 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GSDMD	P57764	484 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SPAG1	Q07617	926 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BICDL2	A1A5D9	508 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UNCX	A6NJT0	531 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IDE	P14735	1019 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EPHA7	Q15375	998 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPBP1	Q86WP2	473 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FCER1A	P12319	257 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EHHADH	Q08426	723 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CYP11B2	P19099	503 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCNE1	P24864	410 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCND2	P30279	289 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MTMR1	Q13613	665 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TMC6	Q7Z403	805 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NEK9	Q8TD19	979 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		32.46	■■■□□ 2.79
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CHMP2A	O43633	222 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OPTN	Q96CV9	577 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PANK4	Q9NVE7	773 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FBXO40	Q9UH90	709 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLITRK3	O94933	977 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EYA4	O95677	639 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CYP4A11	Q02928	519 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	P2RX5	Q93086	422 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		32.44	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CLCN1	P35523	988 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PSMC6	P62333	389 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	32.43	■■■□□ 2.78	6e-11	■□□□□ 10.8
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VSTM4	Q8IW00	320 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DYDC2	Q96IM9	177 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RGL1	Q9NZL6	768 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600		A0A1B0GTH6	734 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	COASY	Q13057	564 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAFG	O15525	162 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NR3C2	P08235	984 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRIM47	Q96LD4	638 aa		32.42	■■■□□ 2.78

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