RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 COBLO75128 1261 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC25A27O95847 323 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 COPB2P35606 906 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 HS1BP3Q53T59 392 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAUS3Q68CZ6 603 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 OTOP1Q7RTM1 612 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 DYMQ7RTS9 669 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CATSPER3Q86XQ3 398 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 TXNRD2Q9NNW7 524 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFNKQ9P0W0 207 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 PFASO15067 1338 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 POTEFA5A3E0 1075 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHMP2AO43633 222 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 GAS7O60861 476 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 RHOBTB3O94955 611 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 FANCCQ00597 558 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP2R5CQ13362 524 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCL15Q16663 113 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 POTEGQ6S5H5 508 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 VSIG10LQ86VR7 867 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR11Q9BZH6 1224 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNH7Q9NS40 1196 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 EXOC1Q9NV70 894 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 PKD2L1Q9P0L9 805 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRCPP42785 496 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDE4DQ08499 809 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD23Q86SG2 305 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRI3BPQ8WY22 251 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 RIT2Q99578 217 aa19.92■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRPM7Q96QT4 1865 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 BTBD19C9JJ37 291 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 NR3C2P08235 984 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPA1P27694 616 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCND2P30279 289 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP4A11Q02928 519 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 B3GNT9Q6UX72 402 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCAPG2Q86XI2 1143 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD35Q8N283 1001 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNERQ8NFT8 737 aa19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDHXO00330 501 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLA2G4BP0C869 781 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERCC3P19447 782 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDC25BP30305 580 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 HUNKP57058 714 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 SEMA3FQ13275 785 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTMR1Q13613 665 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA1Q5VX52 437 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 NELFBQ8WX92 580 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX12PQ92771 950 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRC27Q9C0I9 530 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGL1Q9NZL6 768 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRBP1Q9UHY1 535 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 SERPINC1P01008 464 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 PSMC6P62333 389 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q3C1V9 767 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 HPS3Q969F9 1004 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 IWS1Q96ST2 819 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 TEKT3Q9BXF9 490 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 UNC45AQ9H3U1 944 aa19.9■□□□□ 0.78
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP2C8P10632 490 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 FCER1AP12319 257 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 IDEP14735 1019 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAK1Q13153 545 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 UNC13DQ70J99 1090 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADSSL1Q8N142 457 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCTD17Q8N5Z5 321 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 PASKQ96RG2 1323 aa19.89■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ESPNB1AK53 854 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 STAM2O75886 525 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF18P17022 549 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERVK-9P63128 1117 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERVK-24P63145 666 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 STK4Q13043 487 aa19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPBP1Q86WP2 473 aa19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms