RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	IL27	Q8NEV9	243 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	NCOR1	O75376	2440 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SEMA3F	Q13275	785 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	NEDD9	Q14511	834 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	METTL7B	Q6UX53	244 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	CUL5	Q93034	780 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	LGR5	O75473	907 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	GJB5	O95377	273 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMARCA1	P28370	1054 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	GRB10	Q13322	594 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	USP26	Q9BXU7	913 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	MEIS2	O14770	477 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	FIBP	O43427	364 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	EFCAB14	O75071	495 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	RSPH10B	P0C881	870 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	HOXC8	P31273	242 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	MCM5	P33992	734 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	RAD9A	Q99638	391 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPR20	Q99678	358 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	MTA3	Q9BTC8	594 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC69	A6NI79	296 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	TREH	O43280	583 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	LPXN	O60711	386 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	RXRA	P19793	462 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMTC2	Q8N394	836 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	EMSY	Q7Z589	1322 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	PIK3CD	O00329	1044 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC27A2	O14975	620 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	GNAQ	P50148	359 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SP4	Q02446	784 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	28.15	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRIM50	Q86XT4	487 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMEM87B	Q96K49	555 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	SETD4	Q9NVD3	440 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	BMP1	P13497	986 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PPP4R4-204	ENST00000555690	KCNQ1	P51787	676 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	AAK1	Q2M2I8	961 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	LINC01553	A4QN01	128 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	CTSH	P09668	335 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	LIFR	P42702	1097 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	CALM1	P0DP23	149 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	CALM2	P0DP24	149 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	CALM3	P0DP25	149 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	NECTIN1	Q15223	517 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	NLRX1	Q86UT6	975 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	AMH	P03971	560 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	GNAT1	P11488	350 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	ERVK-21	P61565	698 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	COG5	Q9UP83	839 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATP9A	O75110	1047 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	INSL6	Q9Y581	213 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	CAND2	O75155	1236 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARHGAP4	P98171	946 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBE2S	Q16763	222 aa		28.08	■■■□□ 2.09

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