RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 BANK1Q8NDB2 785 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 RNPEPQ9H4A4 650 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 H3BRB1 525 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 LGALS2P05162 132 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 CLUL1Q15846 466 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 SLC35G1Q2M3R5 365 aa18.71■□□□□ 0.59
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CS-227ENST00000551441 TMEM192Q8IY95 271 aa18.71■□□□□ 0.59
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CS-227ENST00000551441 SETD4Q9NVD3 440 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 MAD2L2Q9UI95 211 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-227ENST00000551441 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
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CS-227ENST00000551441 SP4Q02446 784 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
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CS-227ENST00000551441 SEPT8Q92599 483 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 TOP1MTQ969P6 601 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 MAF1Q9H063 256 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 CLDND1Q9NY35 253 aa18.7■□□□□ 0.58
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CS-227ENST00000551441 H3BNC9 293 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 ZBTB5O15062 677 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 CYFIP1Q7L576 1253 aa18.69■□□□□ 0.58
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CS-227ENST00000551441 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 SENP2Q9HC62 589 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 TRIOO75962 3097 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 POLR2MP0CAP2 368 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 KCNV1Q6PIU1 500 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 MTMR8Q96EF0 704 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 KRT23Q9C075 422 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 IL25Q9H293 177 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 ALADP13716 330 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 CTNNB1P35222 781 aa18.67■□□□□ 0.58
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CS-227ENST00000551441 ARHGAP4P98171 946 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 GHRHRQ02643 423 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 SEC23AQ15436 765 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 DCXO43602 365 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 SEMA3FQ13275 785 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 RPAINQ86UA6 219 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 TICAM2Q86XR7 235 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 SAMD11Q96NU1 681 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 GPR20Q99678 358 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 IGFLR1Q9H665 355 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 GRM6O15303 877 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 HOXC8P31273 242 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 ZP2Q05996 745 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 FIBCD1Q8N539 461 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-227ENST00000551441 CYTH3O43739 400 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 IGHDP01880 384 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 TGFB3P10600 412 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 GHRP10912 638 aa18.64■□□□□ 0.57
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CS-227ENST00000551441 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
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CS-227ENST00000551441 IL17RAQ96F46 866 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 KAT6AQ92794 2004 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 CHRNA1P02708 482 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 GRM4Q14833 912 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 FBXL18Q96ME1 805 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 USP26Q9BXU7 913 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-227ENST00000551441 RIOX1Q9H6W3 641 aa18.63■□□□□ 0.57
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