RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 TET1Q8NFU7 2136 aa22.81■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 PRDM1O75626 825 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 RETREG2Q8NC44 543 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF536O15090 1300 aa22.8■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 TSPY2A6NKD2 308 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 DEXIO95424 95 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 FDX1P10109 184 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 IL9P15248 144 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNA5P22460 613 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 TROAPQ12815 778 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPRSQ13332 1948 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.79■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 MYH4Q9Y623 1939 aa22.79■■□□□ 1.24
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CTDSP2-204ENST00000548823 LCHNA4D1U4 455 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 DCXO43602 365 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNJ6P48051 423 aa22.78■■□□□ 1.24
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CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 POTEBQ6S5H4 581 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.78■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM29Q14134 588 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 PHKBQ93100 1093 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 VTA1Q9NP79 307 aa22.77■■□□□ 1.24
CTDSP2-204ENST00000548823 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 RASA1P20936 1047 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TFAP4Q01664 338 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 GUCY1B3Q02153 619 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF146Q9NTX7 359 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 CPT1AP50416 773 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 ERVK-21P61565 698 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 FUT2Q10981 343 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 BFSP2Q13515 415 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TKFCQ3LXA3 575 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 MKL1Q969V6 931 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.76■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 PPFIA3O75145 1194 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 FOSBP53539 338 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 YEATS4O95619 227 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 MYL3P08590 195 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 MORC4Q8TE76 937 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 USP28Q96RU2 1077 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 SIP14410 1827 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TSPY3P0CV98 308 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TSPY8P0CW00 308 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 BMP3P12645 472 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 KIF5BP33176 963 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 NOVP48745 357 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 AIFM3Q96NN9 605 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 RAD9AQ99638 391 aa22.73■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTDSP2-204ENST00000548823 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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