RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 MSRAQ9UJ68 235 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNA1BQ00975 2339 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-215ENST00000544584 EMSYQ7Z589 1322 aa6.4□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MYH6P13533 1939 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ESYT2A0FGR8 921 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MYADML2A6NDP7 307 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BRB1 525 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 M0QZ92 97 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MEIS2O14770 477 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 DEXIO95424 95 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CD4P01730 458 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BMP1P13497 986 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 IFNAR1P17181 557 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RXRAP19793 462 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC26A2P50443 739 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 APOBRQ0VD83 1088 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM29Q14134 588 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MFSD10Q14728 455 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB30Q15771 203 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PTGISQ16647 500 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP55Q53EZ4 464 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RASEFQ8IZ41 740 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D5Q92609 795 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 GLG1Q92896 1179 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SENP2Q9HC62 589 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 IL23AQ9NPF7 189 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TBX21Q9UL17 535 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KIF3AQ9Y496 699 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ASTN1O14525 1302 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBBXA8MT70 800 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 B4GALT4O60513 344 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BAIAP3O94812 1187 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNJ6P48051 423 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PSEN2P49810 448 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 EVCP57679 992 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 NLRP5P59047 1200 aa6.38□□□□□ -1.39
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CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP1Q07960 439 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PTK7Q13308 1070 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ODR4Q5SWX8 454 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.38□□□□□ -1.39
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CLSTN3-215ENST00000544584 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ALG1Q9BT22 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 JADE2Q9NQC1 790 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 COL20A1Q9P218 1284 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 NRCAMQ92823 1304 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 MCM3APO60318 1980 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 C5orf42Q9H799 3197 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 USP34Q70CQ2 3546 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-215ENST00000544584 NID2Q14112 1375 aa6.37□□□□□ -1.39
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