RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533054.5

ROBO4-208, Transcript of roundabout guidance receptor 4, human

TSL 2 BASIC

Gene ROBO4, Length 3,071 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ROBO4-208	ENST00000533054	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	COQ9	O75208	318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	DPYD	Q12882	1025 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	ABCB11	O95342	1321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TRAF5	O00463	557 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	ICAM1	P05362	532 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	USP11	P51784	963 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	MYL5	Q02045	173 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	LRMP	Q12912	555 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TRAF1	Q13077	416 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF536	O15090	1300 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF75D	P51815	510 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	AK8	Q96MA6	479 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	GLTPD2	A6NH11	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	POTEC	B2RU33	542 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	VWA5A	O00534	786 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SORBS3	O60504	671 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PAX3	P23760	479 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	MNAT1	P51948	309 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	MORC3	Q14149	939 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SREBF1	P36956	1147 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	COG2	Q14746	738 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	ECM1	Q16610	540 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054		E9PMD0	336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	MSH4	O15457	936 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	CAPN15	O75808	1086 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PTGS1	P23219	599 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	GRB10	Q13322	594 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	MLKL	Q8NB16	471 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PDE4D	Q08499	809 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	NCAPH	Q15003	741 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ROBO4-208	ENST00000533054	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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