RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531129.5

GPATCH4-215, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 5

Gene GPATCH4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-215	ENST00000531129	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	TROAP	Q12815	778 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRDN	Q13061	729 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
GPATCH4-215	ENST00000531129	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129		E7EWF7	191 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	UPP2	O95045	317 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	AMH	P03971	560 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	CHML	P26374	656 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	HOXC8	P31273	242 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	ANTXR2	P58335	489 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	WTAP	Q15007	396 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	GPR20	Q99678	358 aa		13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	ERICH2	A1L162	156 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	ICAM3	P32942	547 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	SP4	Q02446	784 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	KCNA5	P22460	613 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	PLA2G5	P39877	138 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	TRAF1	Q13077	416 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	SEPT8	Q92599	483 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	SI	P14410	1827 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	FIBP	O43427	364 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	IL9	P15248	144 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	NEDD9	Q14511	834 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	MEIS2	O14770	477 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	ATP9A	O75110	1047 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	ADAM17	P78536	824 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	GPM6B	Q13491	265 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129		H3BNC9	293 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	SGSM2	O43147	1006 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	STAM2	O75886	525 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	CHRNA1	P02708	482 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	NCOR1	O75376	2440 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPATCH4-215	ENST00000531129	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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