RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 PAK1Q13153 545 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CR1LQ2VPA4 569 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 SP8Q8IXZ3 490 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 UBXN4Q92575 508 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 SPATA25Q9BR10 227 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.44□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 LTFP02788 710 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 SLURP1P55000 103 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 ITGA1P56199 1179 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CAP1Q01518 475 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 TUSC3Q13454 348 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 TEPPQ6URK8 271 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 LIPIQ6XZB0 460 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 LILRB2Q8N423 598 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 KYQ8NBH2 561 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 NTMQ9P121 344 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 DSEQ9UL01 958 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.43□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CRTAMO95727 393 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 LRG1P02750 347 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 APPP05067 770 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 HOXA5P20719 270 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 ST5P78524 1137 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 C2orf27AQ580R0 203 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CARFQ8N187 725 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 LNPKQ9C0E8 428 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 SH3D21A4FU49 640 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 PYGMP11217 842 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 NAT1P18440 290 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 THBS2P35442 1172 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 TTLL6Q8N841 843 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 FBXW5Q969U6 566 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CD244Q9BZW8 370 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 USP40Q9NVE5 1235 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.41□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 KRT15P19012 456 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 DNM2P50570 870 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CTSWP56202 376 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 KCTD1Q719H9 257 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 CROTQ9UKG9 612 aa6.4□□□□□ -1.38
CPEB4-210ENST00000522344 RASGRP1O95267 797 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 ADAM9Q13443 819 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 PHF19Q5T6S3 580 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 LILRA6Q6PI73 481 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 OSTM1Q86WC4 334 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 CLIC6Q96NY7 704 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.39□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC66A2RUB6 948 aa6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 ARVCFO00192 962 aa6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 KCNK3O14649 394 aa6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 GSTA4O15217 222 aa6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 EFCAB14O75071 495 aa6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 PDE6AP16499 860 aa6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 FAHP16930 419 aa6.38□□□□□ -1.39
CPEB4-210ENST00000522344 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms