RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519485.1

CSMD3-209, Transcript of CUB and Sushi multiple domains 3, human

TSL 3

Gene CSMD3, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSMD3-209	ENST00000519485	BCL6	P41182	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	FOXE3	Q13461	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	DIO2	Q92813	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	EDA	Q92838	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	SHD	Q96IW2	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	KLHL18	O94889	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	HOXC12	P31275	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	FHL2	Q14192	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	NCAPH	Q15003	741 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485		Q6ZUG5	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	FOXS1	O43638	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	MAFK	O60675	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CP	P00450	1065 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	INHBE	P58166	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	LSAMP	Q13449	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	MYOT	Q9UBF9	498 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	DGKI	O75912	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	KNG1	P01042	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	LTBR	P36941	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	GJA8	P48165	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	DPT	Q07507	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CSF2RB	P32927	897 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	LMF1	Q96S06	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CSMD3-209	ENST00000519485	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	CAPNS1	P04632	268 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	TCF3	P15923	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	KRIT1	O00522	736 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	ZNF202	O95125	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CSMD3-209	ENST00000519485	COMT	P21964	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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