RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADCY7P51828 1080 aa28.28■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIM50Q86XT4 487 aa28.28■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 BFSP2Q13515 415 aa28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 NLRX1Q86UT6 975 aa28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 RETREG2Q8NC44 543 aa28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 GPRASP2Q96D09 838 aa28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PBX4Q9BYU1 374 aa28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.27■■■□□ 2.12
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMCO2A6NFE2 343 aa28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 H3BRB1 525 aa28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNA2P16389 499 aa28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 GPNMBQ14956 572 aa28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 RUFY3Q7L099 469 aa28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 PHKBQ93100 1093 aa28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTPRSQ13332 1948 aa28.26■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDH23Q9H251 3354 aa28.25■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 SCG2P13521 617 aa28.25■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 PKN1Q16512 942 aa28.25■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.25■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANO3Q9BYT9 981 aa28.25■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.25■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCT2P78371 535 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 MTMR1Q13613 665 aa28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 NTRK3Q16288 839 aa28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CAGE1Q8TC20 777 aa28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 JADE2Q9NQC1 790 aa28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 KAT6AQ92794 2004 aa28.24■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZBBXA8MT70 800 aa28.23■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.23■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.23■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CKBP12277 381 aa28.23■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 EVCP57679 992 aa28.23■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYLIPQ8WY64 445 aa28.23■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 TIFAQ96CG3 184 aa28.23■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYO9BQ13459 2157 aa28.23■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 EYSQ5T1H1 3165 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 PFKMP08237 780 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 RFC2P35250 354 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 RABGGTBP53611 331 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 RBL2Q08999 1139 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTK7Q13308 1070 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.22■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 SELPP16109 830 aa28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 HOXC8P31273 242 aa28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 GRIN2CQ14957 1233 aa28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.112e-10■□□□□ 10.1
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LAPTM4B-202ENST00000517924 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa28.21■■■□□ 2.11
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM265A0A087WTH1 108 aa28.2■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.2■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 NBNO60934 754 aa28.2■■■□□ 2.1
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LAPTM4B-202ENST00000517924 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 TCTN1Q2MV58 587 aa28.2■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.2■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 CDHR1Q96JP9 859 aa28.2■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.2■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 TREHO43280 583 aa28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARP10275 920 aa28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYOGP15173 224 aa28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 SERINC5Q86VE9 423 aa28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa28.19■■■□□ 2.1
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.19■■■□□ 2.1
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