RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 SREBF1P36956 1147 aa29.27■■■□□ 2.28
TCEA1-202ENST00000517351 KIAA0753Q2KHM9 967 aa29.27■■■□□ 2.28
TCEA1-202ENST00000517351 SESTD1Q86VW0 696 aa29.27■■■□□ 2.28
TCEA1-202ENST00000517351 MXRA8Q9BRK3 442 aa29.27■■■□□ 2.28
TCEA1-202ENST00000517351 NOD1Q9Y239 953 aa29.27■■■□□ 2.28
TCEA1-202ENST00000517351 MAFGO15525 162 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 ATP9AO75110 1047 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 KCNA2P16389 499 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 SP4Q02446 784 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 C8orf34Q49A92 452 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 MCTP2Q6DN12 878 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 C7orf31Q8N865 590 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 GPR20Q99678 358 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 C16orf70Q9BSU1 422 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 PKD2L1Q9P0L9 805 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 HDAC6Q9UBN7 1215 aa29.26■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 ADAMTS3O15072 1205 aa29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 DEXIO95424 95 aa29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 LGALS2P05162 132 aa29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 CCL23P55773 120 aa29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 SCRN1Q12765 414 aa29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 PTGISQ16647 500 aa29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 SH3GLB2Q9NR46 395 aa29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa29.25■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 ARHGAP4P98171 946 aa29.24■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.24■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 BICD2Q8TD16 824 aa29.24■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 WNT8AQ9H1J5 351 aa29.24■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 TELO2Q9Y4R8 837 aa29.24■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 PFKFB2O60825 505 aa29.23■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF76P36508 570 aa29.23■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 NEK4P51957 841 aa29.23■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 NLRP5P59047 1200 aa29.23■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 CEP55Q53EZ4 464 aa29.23■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 KCNH7Q9NS40 1196 aa29.23■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 H3BRB1 525 aa29.22■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 CDKL5O76039 1030 aa29.22■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 RASGRP4Q8TDF6 673 aa29.22■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.274e-6■■■□□ 15.2
TCEA1-202ENST00000517351 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 ACRP10323 421 aa29.21■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 C16orf59Q7L2K0 433 aa29.21■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 SCLYQ96I15 445 aa29.21■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 IL23AQ9NPF7 189 aa29.21■■■□□ 2.27
TCEA1-202ENST00000517351 ARP10275 920 aa29.2■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 BFSP2Q13515 415 aa29.2■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM240Q5SV17 173 aa29.2■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 CRYGNQ8WXF5 182 aa29.2■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.2■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 MEIS1O00470 390 aa29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 CYP3A4P08684 503 aa29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 TRIM50Q86XT4 487 aa29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 RETREG2Q8NC44 543 aa29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 SEPT1Q8WYJ6 367 aa29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 AIFM3Q96NN9 605 aa29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 PITPNM1O00562 1244 aa29.18■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF365Q70YC5 407 aa29.18■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 NIPA1Q7RTP0 329 aa29.18■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC155Q8N6L0 562 aa29.18■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 SDF4Q9BRK5 362 aa29.18■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 FAM86B1E9PN63 330 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 FAM86B2P0C5J1 330 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 ME3Q16798 604 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 GPR153Q6NV75 609 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 PLA2G4DQ86XP0 818 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 CAGE1Q8TC20 777 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 SLC9A2Q9UBY0 812 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 PCDHA4Q9UN74 947 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 NFASCO94856 1347 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 STK36Q9NRP7 1315 aa29.17■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 LARGE1O95461 756 aa29.16■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa29.16■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa29.16■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 HIC1Q14526 733 aa29.16■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 NECAB1Q8N987 351 aa29.16■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa29.15■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 C17orf102A2RUQ5 167 aa29.15■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 DTNBO60941 627 aa29.15■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 CTDNEP1O95476 244 aa29.15■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 FGBP02675 491 aa29.15■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 IQCF3P0C7M6 154 aa29.15■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 PTK7Q13308 1070 aa29.15■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 BLIDQ8IZY5 108 aa29.14■■■□□ 2.26
TCEA1-202ENST00000517351 AFAP1L1Q8TED9 768 aa29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms