RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	SBF1	O95248	1867 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	DOCK1	Q14185	1865 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYMK	A6NI61	221 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	VWA5A	O00534	786 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	MSH4	O15457	936 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	CBFA2T2	O43439	604 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	MARCH6	O60337	910 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	DGAT1	O75907	488 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	FLOT1	O75955	427 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATP1A3	P13637	1013 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	CLCN1	P35523	988 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	OAZ1	P54368	228 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	ECM1	Q16610	540 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRR16	Q569H4	304 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	SV2B	Q7L1I2	683 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNK18	Q7Z418	384 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	DRC7	Q8IY82	874 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADSSL1	Q8N142	457 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPC24	Q8NBT2	197 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	REPS2	Q8NFH8	660 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	RAD54L	Q92698	747 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	GJA10	Q969M2	543 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC102A	Q96A19	550 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAF1	Q9H063	256 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	IFNK	Q9P0W0	207 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	VAV3	Q9UKW4	847 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	FZD1	Q9UP38	647 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATP2C1-223	ENST00000515854	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYPN	Q86TC9	1320 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADM5	C9JUS6	153 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MEIS1	O00470	390 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	NFIB	O00712	420 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATP2A1	O14983	1001 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	EVI5	O60447	810 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MED24	O75448	989 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PSMD10	O75832	226 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	SERPINC1	P01008	464 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	BCR	P11274	1271 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ALAS1	P13196	640 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTGS1	P23219	599 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	RPA1	P27694	616 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF76	P36508	570 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	STAT3	P40763	770 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP1R2	P41236	205 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRCP	P42785	496 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	HMGCS2	P54868	508 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBASH3A	P57075	661 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	EHHADH	Q08426	723 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PAK1	Q13153	545 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	VGLL4	Q14135	290 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MCM6	Q14566	821 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	COG2	Q14746	738 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TKFC	Q3LXA3	575 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	CEP55	Q53EZ4	464 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	DLK2	Q6UY11	383 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	UNC13D	Q70J99	1090 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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