RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA33Q96N06 139 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MEIS1O00470 390 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ZEB2O60315 1214 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MYL3P08590 195 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ARP10275 920 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ICAM3P32942 547 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 LAMC2Q13753 1193 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC41Q15345 812 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 AFG1LQ8WV93 481 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFRSF25Q93038 417 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MYADML2A6NDP7 307 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MAFGO15525 162 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 STX6O43752 255 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MCM7P33993 719 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 GJA9P57773 515 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 SP2Q02086 613 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP1Q07960 439 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 SEMA3FQ13275 785 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 NIPA1Q7RTP0 329 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 CRYGNQ8WXF5 182 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 FERMT2Q96AC1 680 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 Q9Y3F1 56 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 LAMA3Q16787 3333 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 COL6A3P12111 3177 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0C4DFX4 3053 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 DNM1LO00429 736 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 GAS7O60861 476 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP9AO75110 1047 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAMTS4O75173 837 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 CIITAP33076 1130 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF174Q15697 407 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNA10Q16322 511 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC38Q5R3I4 469 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 METTL7BQ6UX53 244 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 HTATIP2Q9BUP3 242 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 SAMM50Q9Y512 469 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 CHMP2AO43633 222 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC37A4O43826 429 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 NEMFO60524 1076 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNA2P16389 499 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 CALCRLQ16602 461 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 Q4G0T1 1027 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 LRCH2Q5VUJ6 765 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MYSM1Q5VVJ2 828 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MOXD1Q6UVY6 613 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 CXCL17Q6UXB2 119 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 PPTC7Q8NI37 304 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-204ENST00000503638 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 MSH4O15457 936 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ASGR1P07306 291 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 MMP3P08254 477 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CYP3A7P24462 503 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ACLYP53396 1101 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 NBR1Q14596 966 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 DGKDQ16760 1214 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 BRAPQ7Z569 592 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 NECAB2Q7Z6G3 386 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 GJA10Q969M2 543 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TEKT3Q9BXF9 490 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 MTMR6Q9Y217 621 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1B-204ENST00000503638 BACH1O14867 736 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms