RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	SEMA3F	Q13275	785 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	SDF4	Q9BRK5	362 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	PSMD10	O75832	226 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	CAP1	Q01518	475 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TTC19-208	ENST00000497842	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	CCL14	Q16627	93 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	RESP18	Q5W5W9	173 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	SHC4	Q6S5L8	630 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	FSIP1	Q8NA03	581 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	SCFD2	Q8WU76	684 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	NFASC	O94856	1347 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	IRF5	Q13568	498 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	VAV3	Q9UKW4	847 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	ATP9A	O75110	1047 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	KCNA2	P16389	499 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	TXLNA	P40222	546 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	PRMT2	P55345	433 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	PPP2R5C	Q13362	524 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	TTLL4	Q14679	1199 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	SPECC1	Q5M775	1068 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	STK24	Q9Y6E0	443 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	MBD3	O95983	291 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	ACVR2B	Q13705	512 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	KATNBL1	Q9H079	304 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	POTEM	A6NI47	508 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	UBA7	P41226	1012 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	NEDD9	Q14511	834 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	IGHA2	P01877	340 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	CYP2C19	P33261	490 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	KRT76	Q01546	638 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	ERMN	Q8TAM6	284 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	EPSTI1	Q96J88	318 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842		A0A1B0GVL5	298 aa		32.07	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		32.07	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	RAET1E	Q8TD07	263 aa		32.07	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		32.07	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		32.07	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		32.07	■■■□□ 2.73
TTC19-208	ENST00000497842	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	PFKFB1	P16118	471 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	SP2	Q02086	613 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	KRT79	Q5XKE5	535 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	USP49	Q70CQ1	688 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	TRIB2	Q92519	343 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	PP2D1	A8MPX8	630 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	CHMP2A	O43633	222 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	LY6K	Q17RY6	165 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	CABP7	Q86V35	215 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	SLC26A4	O43511	780 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	ARIH2	O95376	493 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	CDC25A	P30304	524 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	SFN	P31947	248 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	HPSE	Q9Y251	543 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	ADCY3	O60266	1144 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	GGPS1	O95749	300 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	LIG1	P18858	919 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	NDUFA8	P51970	172 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TTC19-208	ENST00000497842	JAK3	P52333	1124 aa		32.04	■■■□□ 2.72

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