RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 SP2Q02086 613 aa26.81■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 PGM5Q15124 567 aa26.81■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 STAG2Q8N3U4 1231 aa26.81■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 NEK9Q8TD19 979 aa26.81■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.8■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 PTPROQ16827 1216 aa26.8■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 EPC2Q52LR7 807 aa26.8■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 TIGD5Q53EQ6 642 aa26.8■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 IL31RAQ8NI17 732 aa26.8■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 C17orf102A2RUQ5 167 aa26.79■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 CAND2O75155 1236 aa26.79■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 ATP6V0A1Q93050 837 aa26.79■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.79■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 KRT23Q9C075 422 aa26.79■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.79■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa26.79■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF318Q5VUA4 2279 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 TRIOO75962 3097 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 KLRF2D3W0D1 207 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 H3BNC9 293 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 H3BRB1 525 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 ZBTB5O15062 677 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 SORBS3O60504 671 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 COL19A1Q14993 1142 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 TOP1MTQ969P6 601 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 C5orf42Q9H799 3197 aa26.78■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 ALADP13716 330 aa26.77■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.77■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 SEPT8Q92599 483 aa26.77■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.77■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.77■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.77■■□□□ 1.88
SIMC1-208ENST00000495423 TREHO43280 583 aa26.76■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa26.76■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.76■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 CCND2P30279 289 aa26.76■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 SEC23AQ15436 765 aa26.76■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 BANK1Q8NDB2 785 aa26.76■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 GPM6BQ13491 265 aa26.75■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 RNPEPQ9H4A4 650 aa26.75■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 TTC3P53804 2025 aa26.74■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 CHMLP26374 656 aa26.74■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 TMEM192Q8IY95 271 aa26.74■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 POLR2MP0CAP2 368 aa26.73■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 USP26Q9BXU7 913 aa26.73■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 BCAS3Q9H6U6 928 aa26.73■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 SLC35G1Q2M3R5 365 aa26.72■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.72■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 SKAP1Q86WV1 359 aa26.72■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 APBB2Q92870 758 aa26.72■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 PRKAG3Q9UGI9 489 aa26.72■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26.71■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 GNAT1P11488 350 aa26.71■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 FAM26DQ5JW98 314 aa26.71■■□□□ 1.87
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SIMC1-208ENST00000495423 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.7■■□□□ 1.87
SIMC1-208ENST00000495423 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SIMC1-208ENST00000495423 DCXO43602 365 aa26.7■■□□□ 1.86
SIMC1-208ENST00000495423 ADAM17P78536 824 aa26.7■■□□□ 1.86
SIMC1-208ENST00000495423 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SIMC1-208ENST00000495423 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.7■■□□□ 1.86
SIMC1-208ENST00000495423 HOMER1Q86YM7 354 aa26.7■■□□□ 1.86
SIMC1-208ENST00000495423 PIGSQ96S52 555 aa26.7■■□□□ 1.86
SIMC1-208ENST00000495423 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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