RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 AP3B2Q13367 1082 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 MTMR1Q13613 665 aa13.73□□□□□ -0.21
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NISCH-214ENST00000490425 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 TRIM22Q8IYM9 498 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 IL17RAQ96F46 866 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 AIFM3Q96NN9 605 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 GPR20Q99678 358 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 SENP7Q9BQF6 1050 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 MXRA8Q9BRK3 442 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 WNT8AQ9H1J5 351 aa13.73□□□□□ -0.21
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NISCH-214ENST00000490425 HDAC6Q9UBN7 1215 aa13.73□□□□□ -0.21
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NISCH-214ENST00000490425 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.72□□□□□ -0.214e-7■■■□□ 18.2
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NISCH-214ENST00000490425 C16orf59Q7L2K0 433 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 TRIM50Q86XT4 487 aa13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-214ENST00000490425 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 TMEM199Q8N511 208 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 C7orf31Q8N865 590 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 NECAB1Q8N987 351 aa13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-214ENST00000490425 SCLYQ96I15 445 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 CDHR1Q96JP9 859 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 UIMC1Q96RL1 719 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 C16orf70Q9BSU1 422 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 KCNH7Q9NS40 1196 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 NOD1Q9Y239 953 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 H3BRB1 525 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 DEXIO95424 95 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 LARGE1O95461 756 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 ARP10275 920 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 GNA11P29992 359 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 HIC1Q14526 733 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD1Q15327 319 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 CEP55Q53EZ4 464 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 SESTD1Q86VW0 696 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 CTAGE1Q96RT6 745 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.216e-7■□□□□ 8.9
NISCH-214ENST00000490425 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.71□□□□□ -0.21
NISCH-214ENST00000490425 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 FAM86B1E9PN63 330 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 MEIS1O00470 390 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 FAM86B2P0C5J1 330 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 NLRP5P59047 1200 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 ME3Q16798 604 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 TMEM240Q5SV17 173 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 BICD2Q8TD16 824 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 CRYGNQ8WXF5 182 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 IL23AQ9NPF7 189 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 SH3GLB2Q9NR46 395 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 MAFGO15525 162 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 CDKL5O76039 1030 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 CTDNEP1O95476 244 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 ZNF365Q70YC5 407 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 VWCEQ96DN2 955 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 PCDHA4Q9UN74 947 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 CDH23Q9H251 3354 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 CHD9Q3L8U1 2897 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 CYP3A4P08684 503 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 BFSP2Q13515 415 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 MCTP2Q6DN12 878 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 DEFB128Q7Z7B8 93 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 RETREG2Q8NC44 543 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 SEPT1Q8WYJ6 367 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 WNT8BQ93098 351 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 GTF3C6Q969F1 213 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 SDF4Q9BRK5 362 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 GJB4Q9NTQ9 266 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 SLC9A2Q9UBY0 812 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-214ENST00000490425 SCN5AQ14524 2016 aa13.68□□□□□ -0.22
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