RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487849.7

HOXB-AS3-212, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 428 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PFKFB2O60825 505 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARHGAP4P98171 946 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SCRN1Q12765 414 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PTGISQ16647 500 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CEP55Q53EZ4 464 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.56■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CYP2C9P11712 490 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SHHQ15465 462 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C8orf34Q49A92 452 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SESTD1Q86VW0 696 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GPR20Q99678 358 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SDF4Q9BRK5 362 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 H3BRB1 525 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LGALS2P05162 132 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CSF2RAP15509 400 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 KCNA2P16389 499 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 XBP1P17861 261 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CCL23P55773 120 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BFSP2Q13515 415 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RETREG2Q8NC44 543 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ATP9AO75110 1047 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 HAS3O00219 553 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WASF1Q92558 559 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MEIS1O00470 390 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 EPHB4P54760 987 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GALNT17Q6IS24 598 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CAGE1Q8TC20 777 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 IL23AQ9NPF7 189 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 STK36Q9NRP7 1315 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PITPNM1O00562 1244 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 CYP3A4P08684 503 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GLG1Q92896 1179 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LRCH3Q96II8 777 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ARP10275 920 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ACRP10323 421 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GNAT1P11488 350 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ME3Q16798 604 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 TRIM50Q86XT4 487 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BLIDQ8IZY5 108 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NECAB1Q8N987 351 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 GTF3C6Q969F1 213 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SCLYQ96I15 445 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AZI2Q9H6S1 392 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 NFASCO94856 1347 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SZT2Q5T011 3432 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM86B1E9PN63 330 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 RFC2P35250 354 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 AIFM3Q96NN9 605 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 ADAMTS3O15072 1205 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 SLC34A2O95436 690 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 FGBP02675 491 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PFKMP08237 780 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PTK7Q13308 1070 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXB-AS3-212ENST00000487849 PRR16Q569H4 304 aa22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms