RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMCO2A6NFE2 343 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 LGALS2P05162 132 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCLYQ96I15 445 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALG1Q9BT22 464 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANO3Q9BYT9 981 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC10-208ENST00000469521 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAFGO15525 162 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNA2P16389 499 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBL2Q08999 1139 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 NTRK3Q16288 839 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 RETREG2Q8NC44 543 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 JADE2Q9NQC1 790 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 GBF1Q92538 1859 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 COL6A3P12111 3177 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 H3BRB1 525 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 FGBP02675 491 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFNAR1P17181 557 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 SREBF1P36956 1147 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 PKN1Q16512 942 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHKBQ93100 1093 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 VWCEQ96DN2 955 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 IQCF3P0C7M6 154 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 HOXC8P31273 242 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANAPC15P60006 121 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 MCTP2Q6DN12 878 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDH23Q9H251 3354 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP9AO75110 1047 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTK7Q13308 1070 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 PGBD1Q96JS3 809 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 C6orf50Q9HD87 102 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM260Q9NX78 707 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 SELPP16109 830 aa21.53■■□□□ 1.04
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SP4Q02446 784 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 CEP55Q53EZ4 464 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGAP4P98171 946 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 SERINC5Q86VE9 423 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM50Q86XT4 487 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 GUCD1Q96NT3 240 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC10-208ENST00000469521 NFASCO94856 1347 aa21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 CKBP12277 381 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 ACTN1P12814 892 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 HIC1Q14526 733 aa21.51■■□□□ 1.03
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TRAPPC10-208ENST00000469521 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 BICD2Q8TD16 824 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL17RAQ96F46 866 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 KAT6AQ92794 2004 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 MEIS1O00470 390 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 CPLX1O14810 134 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM161BQ96MY7 647 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC10-208ENST00000469521 SDF4Q9BRK5 362 aa21.5■■□□□ 1.03
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