RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 ZBTB43O43298 467 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 BAIAP3O94812 1187 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 CA3P07451 260 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 FGD1P98174 961 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 HIC1Q14526 733 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 KRT32Q14532 448 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 RTN1Q16799 776 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 USP38Q8NB14 1042 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 WNT8BQ93098 351 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 GPR20Q99678 358 aa25.02■■□□□ 1.6
TTC28-204ENST00000468807 PARNO95453 639 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 RBL2Q08999 1139 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 USP26Q9BXU7 913 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.01■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 KIF28PB7ZC32 967 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 NBNO60934 754 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 THPOP40225 353 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 ADGRE1Q14246 886 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 GPNMBQ14956 572 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 TRIM50Q86XT4 487 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 HERC6Q8IVU3 1022 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 PCDHA6Q9UN73 950 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 TELO2Q9Y4R8 837 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 NAPAP54920 295 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 CERS4Q9HA82 394 aa24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 SERINC5Q86VE9 423 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 GPRASP2Q96D09 838 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 CDHR1Q96JP9 859 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.98■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 TREHO43280 583 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 TLL1O43897 1013 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 CXCL10P02778 98 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 CPA1P15085 419 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 MTMR1Q13613 665 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 SETD4Q9NVD3 440 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 TRANK1O15050 2925 aa24.97■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 PTPRSQ13332 1948 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 ATP9AO75110 1047 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 RSPH10BP0C881 870 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 ITGB5P18084 799 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 DEFB103AP81534 67 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.96■■□□□ 1.59
TTC28-204ENST00000468807 KAT6AQ92794 2004 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 GNAT1P11488 350 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 KCNA2P16389 499 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 ARHGAP4P98171 946 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 IKBKEQ14164 716 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 MBTPS1Q14703 1052 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 TCTN1Q2MV58 587 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 PGBD1Q96JS3 809 aa24.95■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 EMSYQ7Z589 1322 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 LGR5O75473 907 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 CTSHP09668 335 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 ADCY7P51828 1080 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.94■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 RFXAPO00287 272 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 MARK3P27448 753 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 HOXC8P31273 242 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-204ENST00000468807 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms