RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.76■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 GHRHRQ02643 423 aa21.76■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 CLUL1Q15846 466 aa21.76■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.76■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.76■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.76■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 GRM6O15303 877 aa21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 KDM4AO75164 1064 aa21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 HYAL1Q12794 435 aa21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 KAT14Q9H8E8 782 aa21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 TECTAO75443 2155 aa21.75■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 MBTPS2O43462 519 aa21.74■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 PGM5Q15124 567 aa21.74■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 IL17RAQ96F46 866 aa21.74■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.74■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 LGALS2P05162 132 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 TGFB3P10600 412 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 BMPR1AP36894 532 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 IQCA1Q86XH1 822 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 RNF135Q8IUD6 432 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 AMNQ9BXJ7 453 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 SETD4Q9NVD3 440 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.73■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 MYH6P13533 1939 aa21.72■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 COL4A6Q14031 1691 aa21.72■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 B4E1Z4 1266 aa21.72■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF213O14771 459 aa21.72■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 NCK2O43639 380 aa21.72■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 CTNNB1P35222 781 aa21.72■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 FIBCD1Q8N539 461 aa21.72■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 MTMR8Q96EF0 704 aa21.72■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 LINC01565O15544 149 aa21.71■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 CAND2O75155 1236 aa21.71■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 RB1P06400 928 aa21.71■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 ADAM17P78536 824 aa21.71■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.71■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 FAM26DQ5JW98 314 aa21.71■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 IER5LQ5T953 404 aa21.71■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LINC00888-201ENST00000468380 TBX10O75333 385 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 CHRNA1P02708 482 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 CAMK1Q14012 370 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 TICAM2Q86XR7 235 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 PRSS33Q8NF86 280 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 APBB2Q92870 758 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 IGFLR1Q9H665 355 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.7■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.69■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 EDAQ92838 391 aa21.69■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 SNX27Q96L92 541 aa21.69■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 STXBP3O00186 592 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 ZBTB5O15062 677 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 CSPG5O95196 566 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 CCND2P30279 289 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 SEMA3FQ13275 785 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 ADAM15Q13444 863 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 TRIM50Q86XT4 487 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 GPR20Q99678 358 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 USP26Q9BXU7 913 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.68■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 USP34Q70CQ2 3546 aa21.67■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 KLRF2D3W0D1 207 aa21.67■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 ENPP3O14638 875 aa21.67■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 SDSP20132 328 aa21.67■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.67■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.67■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 RILPL2Q969X0 211 aa21.67■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
LINC00888-201ENST00000468380 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms