RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 KCNA2P16389 499 aa23.67■■□□□ 1.38
VARS-218ENST00000459667 PSEN2P49810 448 aa23.67■■□□□ 1.38
VARS-218ENST00000459667 SP4Q02446 784 aa23.67■■□□□ 1.38
VARS-218ENST00000459667 CEP55Q53EZ4 464 aa23.67■■□□□ 1.38
VARS-218ENST00000459667 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.67■■□□□ 1.38
VARS-218ENST00000459667 GTF3C6Q969F1 213 aa23.67■■□□□ 1.38
VARS-218ENST00000459667 AIFM3Q96NN9 605 aa23.67■■□□□ 1.38
VARS-218ENST00000459667 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.67■■□□□ 1.38
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VARS-218ENST00000459667 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.65■■□□□ 1.38
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VARS-218ENST00000459667 CYP2C18P33260 490 aa23.64■■□□□ 1.37
VARS-218ENST00000459667 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.371e-6■■■□□ 18.6
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VARS-218ENST00000459667 TMEM199Q8N511 208 aa23.63■■□□□ 1.37
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VARS-218ENST00000459667 FAM86B1E9PN63 330 aa23.62■■□□□ 1.37
VARS-218ENST00000459667 H3BRB1 525 aa23.62■■□□□ 1.37
VARS-218ENST00000459667 FAM86B2P0C5J1 330 aa23.62■■□□□ 1.37
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VARS-218ENST00000459667 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.6■■□□□ 1.37
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VARS-218ENST00000459667 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
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VARS-218ENST00000459667 M0R2N6 131 aa23.58■■□□□ 1.37
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VARS-218ENST00000459667 JAK2O60674 1132 aa23.57■■□□□ 1.36
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VARS-218ENST00000459667 PRR16Q569H4 304 aa23.57■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.57■■□□□ 1.36
VARS-218ENST00000459667 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.57■■□□□ 1.36
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