RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 GJA10Q969M2 543 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 CAPZA3Q96KX2 299 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 ALS2CR12Q96Q35 445 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 JADE2Q9NQC1 790 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 SNX12Q9UMY4 172 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 EXOC4Q96A65 974 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 VIPAS39Q9H9C1 493 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 PSD3Q9NYI0 1048 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNMA1Q12791 1236 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 ERMNQ8TAM6 284 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 AMNQ9BXJ7 453 aa25.53■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 SIPA1L1O43166 1804 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 CYP11B2P19099 503 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 MAGEA1P43355 309 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 ITIH3Q06033 890 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 POTEB3A0JP26 581 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 POTECB2RU33 542 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 Q4G0T1 1027 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 POTEBQ6S5H4 581 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-202ENST00000399409 MEIS2O14770 477 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 RAD21O60216 631 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ARHGAP4P98171 946 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 EDRF1Q3B7T1 1238 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 GMCL1Q96IK5 515 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ICA1Q05084 483 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 RUBCNQ92622 972 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.51■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC12A3P55017 1021 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 TCP10Q12799 353 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SFMBT2Q5VUG0 894 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SUGCTQ9HAC7 445 aa25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 MED24O75448 989 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SERPING1P05155 500 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 TCP1P17987 556 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 MMP14P50281 582 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 MMGT1Q8N4V1 131 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ERICH4A6NGS2 130 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 HGSNATQ68CP4 663 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 FBXO11Q86XK2 927 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 MED4Q9NPJ6 270 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAM21Q9UKJ8 722 aa25.49■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 MOCS3O95396 460 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 DACT2Q5SW24 774 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM71BQ8TC56 605 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM20AQ96MK3 541 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 HYOU1Q9Y4L1 999 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 F5H6K3 240 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF185O15231 689 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SLURP2P0DP57 97 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 CACNB3P54284 484 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 KLRC3Q07444 240 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SPIRE1Q08AE8 756 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-202ENST00000399409 CREG2Q8IUH2 290 aa25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms