RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD65E5RJM6 399 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ITIH3Q06033 890 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 SLMAPQ14BN4 828 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 SPZ1Q9BXG8 430 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 VIPAS39Q9H9C1 493 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ORC4O43929 436 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 PRDX5P30044 214 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 DPYDQ12882 1025 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 XKR9Q5GH70 373 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 CDAN1Q8IWY9 1227 aa17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 NSFP46459 744 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 RAD9BQ6WBX8 426 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 NT5C1BQ96P26 610 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 MXD3Q9BW11 206 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 AP1M1Q9BXS5 423 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 PLAAQ9Y263 795 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 COMMD10Q9Y6G5 202 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 NMT2O60551 498 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ABCB5Q2M3G0 1257 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR11Q9BZH6 1224 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 EDEM3Q9BZQ6 932 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 PTPN22Q9Y2R2 807 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 H0YCG3 227 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRN2O75325 713 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 BPIFB4P59827 614 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 GRM4Q14833 912 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE2SQ16763 222 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 PHF20Q9BVI0 1012 aa17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA0825Q8IV33 1275 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 KAZALD1Q96I82 304 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 NACC1Q96RE7 527 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 BARHL2Q9NY43 387 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 AK9Q5TCS8 1911 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ECEL1O95672 775 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 PALM2Q8IXS6 379 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF653Q96CK0 615 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 CHP1Q99653 195 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 MEIS1O00470 390 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPA1LP34931 641 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 IL9RQ01113 521 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 DR1Q01658 176 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 MINPP1Q9UNW1 487 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 PP2D1A8MPX8 630 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX16P57768 344 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 LMNB2Q03252 620 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 PTK2Q05397 1052 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 DLGAP5Q15398 846 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.442e-7■□□□□ 10.1
CTDSP2-201ENST00000398073 CCSER1Q9C0I3 900 aa17.8■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 H0YIN7 160 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 DLATP10515 647 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP7D1Q3KQU3 841 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 USP49Q70CQ1 688 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 SUPT20HQ8NEM7 779 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 RSAD2Q8WXG1 361 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 PARVGQ9HBI0 331 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF148Q9UQR1 794 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 POTEMA6NI47 508 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ADSSL1Q8N142 457 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA4Q8NEY3 305 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 TCP11Q8WWU5 503 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 RUBCNQ92622 972 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 CSF1RP07333 972 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ICE2Q659A1 982 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 TECPR2O15040 1411 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 LIG4P49917 911 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 SGO2Q562F6 1265 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 REXO1L1PQ8IX06 675 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 DEPTORQ8TB45 409 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC8CQ8TDW0 803 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 RAD54LQ92698 747 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM11Q96F44 468 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 VWDEQ8N2E2 1590 aa17.79■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0G2JLW4 131 aa17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 GRID2IPA4D2P6 1211 aa17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM205CA6NFA0 338 aa17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 RASGRF2O14827 1237 aa17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 BBOX1O75936 387 aa17.78■□□□□ 0.44
CTDSP2-201ENST00000398073 FGGP02679 453 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms