RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 MYO9BQ13459 2157 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 NOP56O00567 594 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 LGALS2P05162 132 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 RBL2Q08999 1139 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 Q6ZUG5 572 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 GPR20Q99678 358 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 MSRAQ9UJ68 235 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 H3BRB1 525 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 RPS6KB1P23443 525 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 APOBRQ0VD83 1088 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 PTK7Q13308 1070 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 GPNMBQ14956 572 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 RAB30Q15771 203 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 WNT8BQ93098 351 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 SENP7Q9BQF6 1050 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.911e-15■□□□□ 8.7
FAAP20-201ENST00000378543 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 CDH23Q9H251 3354 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 CKBP12277 381 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 ACTN1P12814 892 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 FOSL2P15408 326 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 SELPP16109 830 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 ITGB5P18084 799 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 RABGGTBP53611 331 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 NAPAP54920 295 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC8DQ7L1W4 858 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 GPRASP2Q96D09 838 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.96■■□□□ 1.91
FAAP20-201ENST00000378543 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ATP9AO75110 1047 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 SP4Q02446 784 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 BRF1Q92994 677 aa26.95■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 STXBP3O00186 592 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 KCNA2P16389 499 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 RUFY3Q7L099 469 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM50Q86XT4 487 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 NID2Q14112 1375 aa26.94■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 MYOGP15173 224 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 PGBD1Q96JS3 809 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 BARHL2Q9NY43 387 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.93■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 PTPRSQ13332 1948 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 C17orf102A2RUQ5 167 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 NBNO60934 754 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 HOXC8P31273 242 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 EVCP57679 992 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 CDHR1Q96JP9 859 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 RNPEPQ9H4A4 650 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 JADE2Q9NQC1 790 aa26.92■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 KAT6AQ92794 2004 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 SMCO2A6NFE2 343 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ADCY7P51828 1080 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 MTMR1Q13613 665 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 SERINC5Q86VE9 423 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ATP6V0A1Q93050 837 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 PRDM12Q9H4Q4 367 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 SLC28A3Q9HAS3 691 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 PKD2L1Q9P0L9 805 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa26.91■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 TREHO43280 583 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 PARNO95453 639 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 CXCL10P02778 98 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ANAPC15P60006 121 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 SLC9A7Q96T83 725 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM260Q9NX78 707 aa26.9■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 BAIAP3O94812 1187 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 MBTPS1Q14703 1052 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 TCTN1Q2MV58 587 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ANO3Q9BYT9 981 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 SETD4Q9NVD3 440 aa26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
FAAP20-201ENST00000378543 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 FOSP01100 380 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
FAAP20-201ENST00000378543 CLK2P49760 499 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms